Izjemna je tudi biotska raznovrstnost jezera in okolice. Prebrati je mogoče, da so tam opazovali 276 vrst
ptic - polovico vseh evropskih vrst; da tam živi 45 vrst
sesalcev – polovica vseh evropskih vrst; leta 125 vrst
dnevnih metuljev – slaba tretjina vseh evropskih vrst; in se mresti tudi 15 vrst
dvoživk – skoraj četrtina vseh evropskih vrst dvoživk. Zato je jezero skupaj z Rakovim Škocjanom in Križno jamo razglašeno za mednarodno zaščiteno območje in je tudi del območja Natura 2000.