Večina Julijskih Alp je zgrajena iz triasnih apnencev, ki so porozni in zato skoraj vsa meteorna voda skoznje izgine v podzemlje. Dolina Triglavskih jezer pa leži na plasti jurskih apnencev, ki so bolj vododržni. K nastanku jezerc je še dodatno prispevala poledenitev, ki je z gruščem in usedlinami ledenikov zamašila razpoke v podlagi. Rdeče jurske apnence je mogoče videti na številnih mestih v dolini. V skalah je pogosto mogoče najti tudi okamenele živali izpred milijonov let. Gore, ki obdajajo dolino, pa so že zgrajene iz narinjenih starejših triasnih apnencev. Jezerska veriga od Tičarice do Zelnarice je na primer dejansko zahodni rob velikanskega nariva, ki so ga gorotvorne sile čez jursko ploščo narinile od severovzhoda.