Atualmente é pároco da Paróquia Santa Rita, em Sorocaba e Vigário Geral da Arquidiocese de Sorocaba.
Além do pastoreio nas paróquias, também acompanha o movimento de Emaús (movimento de jovens, duas equipes de Nossa Senhora e também apresenta o programa “Ser Igreja no Novo Milênio” aos sábados das 09hs às 10hs pela Cantate FM (http://www.cantatefm.com.br/), rádio católica de Votorantim-SP (104,5 Mhz).
Pe. Júnior gosta de música e de fazer novos amigos. Ele também está no Orkut como “Padre Manoel Júnior”.