ここのチャンドラーの反応の意味は分かりましたでしょうか。
関西人と同じで「ツッコみたいのにツッコめない」ということです。口の中に物が入ってるからですね。
ここの「go down」は単純に考えると「海軍が潜水艦に乗って水中(down)に移動する」です。
「Down」は「南」という意味もあり、
オーストラリアが「down under」と呼ばれることをSeason 2 Episode2 で取り上げています。
チャンドラーがここでツッコみたいのは、
「down」が「人間の下半身」という意味も持っているからです。（Season 2 Episode 21 解説12も参照）
「女の下半身に2年間もヤってられるか！」がツッコミの主旨です。