Głównym narzędziem Metodologii Struktury Logicznej i podstawą etapu planowania jest matryca logiczna (nazywana też macierzą) projektu. Określa ona logikę projektu (działania → rezultaty → cel projektu → cel strategiczny) i opisuje ważne założenia oraz czynniki ryzyka, które tę logikę warunkują. Powyższe pozwalają stwierdzić wykonalność projektu (lub jej brak). Dla celów zarządzania i nadzoru nad przedsięwzięciem matryca dostarcza danych w postaci listy działań, wymaganych zasobów i zakresów odpowiedzialności. Wreszcie, zawierając dane pozwalające zmierzyć oraz zweryfikować stopień osiągnięcia zakładanych celów na poszczególnych poziomach projektu (wskaźniki osiągnięć plus źródła weryfikacji), staje się skutecznym narzędziem monitorowania i oceny.
Przygotowanie projektu obejmuje całokształt procesów, decyzji i działań, które należy podjąć PRZED wypełnieniem wniosku o wsparcie. Jakość wniosku, a więc prawdopodobieństwo przyjęcia projektu do finansowania i jego miejsce w rankingu (wynik oceny merytorycznej), prawie w całości zależy od jakości wypracowanej propozycji projektowej.
Analiza interesariuszy, punkt wyjścia i podstawa analizy problemów, opiera się na identyfikacji wszelkich grup i osób, które w jakikolwiek sposób mogą podlegać wpływowi planowanego projektu lub wywierać na niego wpływ. Każda z nich jest badana za pomocą odpowiednich technik (wywiady, dyskusje), a wyniki analiz dokumentowane. Chodzi o uzyskanie informacji pozwalających określić interesy, oczekiwania oraz potencjał każdego interesariusza, które następnie będą stanowić podstawę dla decyzji w zakresie organizacji pracy w okresie przygotowawczym, a zwłaszcza niezbędnych badań przed procesem konsultacji i planowania. Wyniki analizy służą do określenia przyszłych możliwych ról w projekcie i stopnia oraz charakteru zaangażowania interesariusza, ale też możliwych zagrożeń dla Analiza interesariuszy – identyfikacja i charakterystyka partnerów, udziałowców, grup docelowych i beneficjentów, których problemy będą poddane analizie i rozwiązywane poprzez wdrożenie projektów oraz których potencjał zostanie wykorzystany. Matryca Logiczna – określenie struktury programu/projektu, sprawdzenie jej wewnętrznej logiki, sformułowanie mierzalnych wskaźników osiągnięcia celów, określenie niezbędnych zasobów i nakładów. Analiza problemów – określenie kluczowych problemów, barier i szans oraz zależności przyczynowo skutkowych między nimi. Harmonogram działań – określenie kolejności i zależności między działaniami, oszacowanie czasu trwania każdego z nich, zdefiniowanie kamieni milowych i przydzielenie zakresów odpowiedzialności. Analiza celów – wyznaczenie pożądanych celówrozwiązań dla zidentyfikowanych problemów oraz zależności między środkami a celami. Oszacowanie budżetu – opracowanie planu wykorzystania zasobów i budżetu. Analiza strategii – identyfikacja różnych strategii służących osiągnięciu wyznaczonych celów, wybór najbardziej odpowiedniej(ich) oraz zdefiniowanie celów programów i projektów. ETAP ANALIZ ETAP PLANOWANIA Identyfikacja interesariuszy IdentyfikacjaA naliza Dedukcja Wybór opcji Definiowanie logiki projektu Uszczegółowianie i operacjonalizowanie 28 wypracowania rezultatów i osiągnięcia celów. Z tego punktu widzenia wśród interesariuszy możemy zidentyfikować cztery główne grupy: odbiorców pomocy, podlegających pozytywnemu wpływowi projektu i jego trwałych rezultatów – beneficjentów ostatecznych, grupę docelową; uczestników/udziałowców projektu – partnerów zaangażowanych we wdrażanie przedsięwzięcia, bezpośrednich i pośrednich beneficjentów; grupy, organizacje i instytucje, które mogą zapewnić dodatkowy wkład w implementację – dostawcy, wykonawcy, firmy doradcze i szkoleniowe, uczelnie, organizacje pozarządowe, itp. (o ile nie są uczestnikami którejś z poprzednich grup); te grupy, które mogą podlegać (lub czuć albo uważać, że podlegają) negatywnemu wpływowi przedsięwzięcia.