כדי לזהות ציטוקינינים בצמח, משתמשים בשיטות זיהוי כימיות ובמבחנים ביולוגיים. שיטות הזיהוי הכימיות כוללות כרומטוגרפיה נוזלית, כרומטוגרפיה גזית, ספקטרוסקופיה של מסה ושיטות אימונולוגיות.
בעבר, המבחנים הביולוגיים היו האמצעי היחיד לזיהוי ציטוקינינים. המבחנים הביולוגיים מבוססים על השפעת הציטוקינין על חלוקת תאים, על התארכות תאים ועל עיכוב ההזדקנות של עלים מנותקים.
ההשפעה החשובה של ציטוקינין - זירוז חלוקת תאים - מנוצלת למבחן ביולוגי המבוסס על השפעת ריכוז הציטוקינין על גידול תאים בתרבית רקמה. כבר בשנות החמישים, מצא החוקר סקוג (Skoog) וקבוצת המחקר שלו שבמקטעי רקמת גבעול של טבק, של סויה ושל צמחים דו-פסיגיים אחרים, מתרחשת חלוקת תאים בתרבית רקמה, כאשר מוסיפים ציטוקינין למצע. הגדילה של תאים חדשים מרקמת גבעול או מקאלוס משמשת למבחן ביולוגי רגיש גם היום. רקמות כאלה מגיבות לתוספת הציטוקינין במצע בהתאם לריכוז שלו. כדי לבדוק את הרגישות של מבחן ביולוגי, הניחו רקמות קאלוס של טבק על מצעים שונים לגידול בתרבית רקמה. בכל מצע היה ריכוז אחר של ציטוקינין. רקמות הקאלוס נשקלו לאחר שגדלו במשך חודש בתרבית. תוצאות הניסוי מובאות באיור. החיסרון של המבחן הביולוגי הזה הוא משך הזמן (כחודש) הדרוש עד לקבלת התוצאות.
בגלל החיסרון הזה פותחו מבחנים ביולוגיים אחרים שנמשכים ימים אחדים בלבד. באיברים מסוימים בצמח, הציטוקינין גורם לגדילת תאים ללא חלוקה. השפעה זו של הציטוקינין מנוצלת למבחנים ביולוגיים המבוססים על השפעת ריכוז הציטוקינין על גדילת פסיגים של צנון ושל לכיד (צמח בר ממשפחת המורכבים). תוצאות הניסוי שבדק את השפעת הריכוז של ציטוקינין על גדילת פסיגי לכיד מובאות באיור. בניסוי הזה, לקחו פיסות של פסיגים מזרעים של לכיד והניחו אותן בכמה צלחות על נייר סינון. בכל צלחת היה ריכוז אחר של ציטוקינין. את מקטעי הפסיגים שקלו בראשית הניסוי וכעבור 4 ימים.
מבחן ביולוגי אחר מתבסס על השפעת הציטוקינין על דחיית ההזדקנות של עלים. אם שמים טיפה של קינטין על גבי עלה מנותק, אפשר לראות שהצבע הירוק באזור הטיפה נשמר זמן רב יותר מאשר באזורים אחרים של העלה. השפעת הקינטין על יציבות הכלורופיל גוברת עם עליית ריכוזו. לכן, ניתן להשתמש בהשפעה זו כמבחן בילוגי לזיהוי חומרים בעלי פעילות ציטוקינינית. תוצאות המבחן שמתקבלות תוך זמן קצר (שלושה ימים) ואופן הבדיקה הפשוט הם יתרונותיו של המבחן הזה. לעומת זאת יש לו חיסרון - הספציפיות הנמוכה של תוצאותיו: תוצאות דומות מתקבלות גם אם משתמשים בחומרים אחרים שאינם ציטוקינינים. לכן נוהגים להשתמש במבחן הזה רק לבדיקה ראשונית, ואילו לזיהוי מדויק של חומר, חייבים להשתמש במבחנים אחרים.