2011年12月

2011年12月5日 月曜日だった．．．

目覚めの悪い朝だった．妙に現実とリンクした夢の中で，存在しないはずの航空券のチケットを探しているのだが，見つからない．いつも使っている財布や手帳の「絵」が生々しく描写されながらも，目的のものが出てこない．結局，目覚まし時計で中断されたときには，寝汗でびっしょりだった．なんとも体が重い．そんな一週間のスタート．

が，大学での仕事はそこまで困難なものではなかったかもしれない．今日もDNA指導の予定がはいっていたのだが，それらをそこそこにこなしながら，自分の実験も行うことができた．二枚貝のPCRとヤツメのプライマー探しだ．さらには，とある論文の査読も完了．返メールも送信．この仕事は，今週いっぱいかかると思っていたので，予想外に速く終わってくれた．そして明日放送のテレビの追加撮影もこなし，なんだかんだで，盛りだくさんの一日．内容と体の疲れのためか，とても今日が月曜日だという気がしなかった．

今週は，たてコンやら，他大学との共同調査＆氷見ラボお泊りなどもあるので，あっという間に過ぎてしまいそうだ．論文書きがどこまで進むかはわからないが（期待がもてないが），せめて実験はこなしていきたい．

2011年12月12日 濃い一週間のスタート!?

週の初めから飛ばした．これまでに雑多なことを片付けてきた甲斐あって，今週は自分の研究に没頭することができそうな予感．と言っても，やることは沢山ある．まずは引き受け仕事の二枚貝DNA実験を再開．MSプライマーのチェックだ．PCR36本×２回＋その泳動2回．昔だったら，なんてことの無い実験だが，最近ここまで時間を割くことが出来なかった．で，結果がまずまずだったので，蛍光ｄUTPを使ったPCRを幾つかのプライマーセットで試した．さらには，明日のひみラボでの初DNA実験のための二枚貝組織の溶かし出し．抽出の後半をひみラボで行う予定．このように，予想よりもいいペースで実験を進めることができた．明朝310で今日のPCRの結果を確認して，もう１セットくらい実験が必要かもしれない．もちろん良好な結果が得られれば，更なるサンプルの追加となるのだが，ま～ほどほどにしておきたい．いずれにせよ，予定よりも早いペースなので，次の実験，いよいよカワヤツメの実験も今週中に開始することができそうだ．

今日は同時に，と言いたいが，結局実験が終わった残りの時間に，論文チェックも行った．現在，TSさん2報，Nさん1報の合計3報が手元にある．このうち，夕方にどうにかTSさんの1報を片付けることができた．で，先ほど自宅残業でNさんの１報も．う～む，いざ読むと，コメントしたいことは盛りだくさんだ．兎に角今は，荒削り（大まかなコメント）をしながら，形にしていくことが大切だろう．

おそらく，今週はこんな感じで進む予定．ちなみに週の後半にカワヤツメ分散論文用のデータ解析を終わらせ（今更，，，），来週は，その文章書きに専念する予定．そして再来週（年内最後の週）は，学内共同プロジェクトの報告書（かなり長い）の執筆に追われる予定だ．こう考えると，それ以外の仕事or新しい仕事は，年明けスタートになりそうだ．もちろん，卒論指導は『別腹』なので，いつでも対応可能．

2011年12月9日 合同調査

筑波大御一行様，ひみラボに御来室．楽しい時間を過ごすことができた．特にNさんが集めてくれたぶりのあらを使ったブリ大根は好評だった．これからの季節にはもってこいの料理だ．同時にお酒も堪能．まずは富山が誇る立山．そしてつくばから持参いただいた日本酒をいただいた．といっても，連日の疲れからか，つくばのお酒をいただくころには私は夢の中．．．でも余ったお酒はもらっていって，自宅で美味しくいただいている．で，気がついたのだが，仕込みはつくばなのだが，使用しているお米は富山産だ．昨夜も私が寝た後にこのいじりがあったのかもしれないが，何かの縁か，それともネタか．何はともあれ，富山のお米がいろいろなところで使われているのは，うれしい限りだ．

一方，肝心の調査の方も無事に終了．つくばの院生さんたちも，何度も今回の調査地に来ているので，かって知ったる者だった．おかげで順調に採集できた．それと同時に，まだまだこの場所にはヤツメが多いことに安心．ごみが目立つのが気になるが．．．

で，そんなこんなで今週も終わってしまった．週を通して風邪気味だったり，イベント（飲み会？）が多かったりしたため，あまり仕事が進まず．だが，担当講義も終わったし，年内残りの時間は，自分の仕事に集中したい．特に来週は，実験とデータ解析に目処をつけたい．計画だけは立派なものができたのだが，，，あとは実行できるかどうか．

2011年12月7日 下調べ

昨夜は久しぶりの生物学科たてコン．3年生以上が対象だ．予想していたよりも盛り上がり，私も楽しむことができた．そして久しぶりに，学生に「絡む」ことができた．というか，絡み甲斐のある学生がいた．持参したおつまみも概ね好評だったようだ．

さて，今日は二日酔いと戦いながら，実験指導やら会議やら．それよりも明日だ．毎年恒例となった筑波大学御一行様が来られる．ヤツメ採りだ．例年だと，駅前に宿をとってもらい，居酒屋で懇親会をするのだが，今年はひみラボを使ってもらう．私を始め，当研究室の学生も参加してもらい，温泉，晩飯，お泊り，そして翌日調査だ．ホテル代が浮くので，悪くはないはずだ．

今日はそのための下調べも行った．何を調べたかと言えば，「心霊スポット」．改めて「参考文献」を見直してみると，ひみラボ近くのトンネル（古い方）が，なかなからしい．明日が楽しみ？だ．で，もちろん，料理もしっかり作る予定．やはり今の時期の氷見らしく，寒ぶりははずせない．もっとも一匹まるごと買う金はないので，粗を買ってきて，ブリ大根だ．もちろん刺身も入手予定．それ以外は，いつものおかず（昨日とほぼ重複）でいいだろう．

そんなことを考えながら，実験指導をやっていたのだが，明日の予定を話しているときに，危うく9時から実験をスタートさせるところだった．気がつけば，明日の1限は講義だ．いやいや，忘れていたわけではない．なぜなら，実験指導の直前に講義スライドを準備して，配布物のコピーまでやっていた．ようするに，物忘れが激しくなったということか．．．

2011年12月20日 年内事務仕事完了宣言！

なんとも大仰なタイトルだが，今日も比較的時間があったので，年内締め切りのややこしそうな仕事に取り掛かった．で，一通りの対応は完了．これで年内残り一週間は，研究中心に活動できる．もちろん，年末の締め切り原稿などもあるが，それは想定内．一方で，論文原稿は先送り確定だが，再解析をスタートさせた．逐次結果をみながら，どのデータを採用するかを決めよう．ただ，その結果次第で考察ががらっとかわるので，まずは結果待ち，，，と言いながら現実逃避中だ．

さて，個々の解析には時間がかかるので，その間に実験もいくつか．二枚貝MSは『全滅』で幕引きさせ，頼まれ仕事のスナヤツメ種判別もほぼ無事に終わったので，もっぱら科研費実験に専念．今は，カワヤツメMSのプライマー追加実験だ．で，結構ナイスなプライマーがちらほら．これまでのデータも含めて，近いうちに解析をやってみよう．どんな解析かは，ここでは内緒．これまでの研究の延長ではあるのだが，新たな方向性だ．

これに加えて，昨日に引き続きGISに取り組んだ．そして，着実に進んでいる．特に今日はラスタデータへの変換に成功！後一歩だ．．．と書くと，見る人が見れば，極めて低レベルなことなんだろう．が，それもまた善し．何はともあれ，GISは面白い．もちろん解析もいいのだが，地図作成にもかなり有効．仏生寺川流域の土地利用と魚類相をあわせた地図をA０ポスターでつくったりすると，ひみラボの展示としては，結構いいかも．

さて，明日も来客があったり，こまごまとした予定があるので，在富勤務．でも，罪悪感を感じるくらいに平穏な研究時間を持てているのはうれしい限りだ．明日も思う存分，まったり？しよう．

2011年12月19日 至って順調，，，ただひとつを除けば

早速だが，今週のひみラボ行きは，木曜日のゼミ以外はあきらめざるを得なくなった．なんだかんだで，細かい予定が入ったり，手かせ足かせがあったり．ということで，今日は朝から在富勤務．

が，中程度のお仕事はあるのだが，大物は無い．ということで，310RUNやら，頼まれヤツメ種判別（アライメント）やら，講義成績つけやら，要旨チェックやらを順調にこなすことができた．さらには，GISに手を出すこともでき，ひみラボ組みが出発した直後に，土地利用地図（？）の読み込みに成功．次は，ベクタデータをラスタデータに変換して，調査地点のレイヤーを作成すれば，目的とする解析に一歩近づくはずだ．

と，こんなに順調にことをすすめて行ったのだが，大きなことを忘れていた．いやいや，意図して忘れようとしていたのかもしれない．今週の大仕事である論文書きだ．と言うことで，自宅残業で論文データと向き合ってみた．で，出た結論が，『解析やり直し』，，，もろもろ考えたところ，この結論に至った．もっとも，やり直すか，今の状況で書き進めるかは悩ましところだ．ということで，主要な解析をやり直してみて，その結果次第で決めることにした．ということで，明日も今日と同じような動きになるだろう．

2011年12月17日 GISのお勉強

午前中に時間がとれたので，自宅でGISのお勉強．ほぼ１から勉強だ．まずは，ArcGISのメーカーHPに掲載されている内容を読んだ．初歩的なことから書かれており，今の私にはぴったり．初めてラスタやらベクタやらがわかった．また幾つかの事例をみていると，現在山崎研でやっているような研究への活用のイメージが湧いてきた．地図さえ入手すれば，どうにでもやっていけそうな気がしてきた．こうなると，すぐにでも試して見たい気もするのだが，やはり時間が．．．それに研究室の共通パソコンを使用するため，占有時間が長くなると，学生が使えなくなるのも気になる．やはり，せめて中間報告が終わってからにした方がよさそうだ．

やりたいことは次々に湧いてくるのだが，『宿題』も多い．実験関連はそこそこ軌道に乗ってきたので，今のペースを維持すればいいとして，やはり今は自分の論文書きだろう．だがそのカワヤツメ分散論文についても，昨日の段階で一連の解析が終了．結果の内容もまずまず，といったところか．さすがに国際誌は無理としても英文誌ならばどうにかなるのでは．．．ということで，予定通りFSを目指そう．

2011年12月15日 記憶の糸を手繰り寄せ，，，

どうにか，カワヤツメ分散論文用の解析を思い出すことができた．特に，いくつものパタンで解析している途中だったMIGRATEの結果を１つの表にまとめていく作業に専念．その過程で，遣り残しのモデルや，やり直しモデルを幾つか計算させ，明日の朝にはすべてが出揃うはず．そしてもうひとつ，StructureでのK決定のための計算を明日行えば，結果は一通り出揃うはずだ．一応，ここまでできれば今週の（最低限の）ノルマはクリア．来週中に原稿を洗い直せば，（この論文に関しては）すっきりと年末を迎えることができる．ちなみに来週は，原稿直しに集中したり，実験したりするために，アポ無しひみラボがあるかも．要旨チェックとかは，gmailに出してもらえれば，ひみラボのネット環境が確保されている限り，対応することができるであろう．

一方，今日も実験は順調．頼まれヤツメ種判別は，ものの見事に『抽出がいまいちかな～』と『PCRの失敗』が一致した．12検体中，1本はダメ．もう1本はぎりぎりなんとか．残りは成功．明日ダイタミと310RUNを行い，週明けにはアライメントして結果を報告しよう．一方，昨日から手を出しているカワヤツメ追加MSの方は，第一陣のプライマー9セットのPCRが完了．いくつかを310RUNしたが，いずれもピーク高すぎ．大幅に希釈して，再度RUNが必要だ．これは来週になりそうだ．このとばっちりをくらって，二枚貝MSの結果もわからず．蛍光の種類が違うからと言って，ｄUTPで蛍光ラベルした二枚貝PCR産物と別蛍光のカワヤツメPCR産物を同時に流してみたのだが，，，やはり横着はするものではないということだろう．

2011年12月14日 疲れが出てきた？

先ほど，同居人の帰りがいつもどおり遅いので，ちび介二人と共にお風呂に入っていた．自分と二人の体を洗い終え，湯船にゆったりとつかった時だった．「誰か」が階段を上がっていく足音が．．．同居人が帰ってきたのかと思ったが，そうではないようだった．う～む．疲れが溜まってきたのだろうか．こういう時にはよくみる．実は昨日，といってもこれはおそらく勘違いなので，「事例」としてカウントしないが，ひみラボでもちょっと気になることが．

昨日は初の本格DNA実験だったので，一人で実験室にこもっていたのだが，職員室からなにやらにぎやかな話し声が聞こえてくる．誰かお客さんが来て，話しが盛り上がっている感じだ．で，その声の中心は『女の人』だった．誰か来てました？

ま～さすがに距離も離れているので，みんなのにぎやかな声が，女の人の声のように聞こえたのだろう．ということで，これは聞き違いということで．

何はともあれ，疲れが溜まってきているのは事実．で，その原因は，朝からの実験やら，事務書類対応やら，学外会議やら．もっともいずれも順調かつ確実にこなしているので，悪くは無い．が，疲れているのだろう．夕方少し時間があったので，カワヤツメ分散で残っていた解析をやってしまおうとデータフォルダを開いたのだが，全～ったく理解できなかった．何をどこまでやっていたのか？解析ソフトはどのように動かせばいいのか？．．．やはり，データ解析はまとめてやりきってしまう方がいいのだろう．これまでの解析の流れをまとめたファイルを読み返したのだが，全然頭に入ってこない．仕方がないので，明日本腰を入れてやりなおそう．さて今夜の自宅残業は，，，一応TSさんの論文直しを試みるが，頭が働かないようならば早々にあきらめよう．

2011年12月13日 久しぶりのゼミ

今日はひみラボで論文紹介ゼミ．でもその前に，二枚貝MSを310RUN．さらに時間があたので，ついでに別のプライマーセットをPCR．ちなみに，夕方310の結果を見てみると，，，ダメだった．どれもネガコンと同じ波形．ゲル泳動像から判断して，一番期待できるプライマーセットだったのだが．あと5セットあるので，とりあえずRUNだけはやっておこう．あまり期待を抱かずに．

さて，ゼミ．プレゼン自体はまーまーというところか．いずれも論文に難ありな感じ．それはさておき，卒論発表会に向けて，要旨書きやプレゼンの更なる向上が必要だ．そのためには練習あるのみ．ということで，来週の中間発表も通常のゼミどおりに要旨書きからプレゼンまで，しっかりやってもらおう．今日もいろいろと指示を出したが，兎に角大切なことは，『自分でしっかり理解すること』と『自分の研究をアピールすること』だ．これらを意識して，実践できれば，モチベーション向上も含めて，いい方向に向かうはずだ．

明日は学外会議．でも午後からなので，午前中は時間がありそうだ．幸いTSさんの2報目の論文査読は先ほどまでの自宅残業で完了．実験に時間を費やそう．二枚貝は310待ちなので，いよいよカワヤツメに手を出すか．

ちなみに，これを読んでいる山崎研OB・OGへ．今年のクリスマスパーティーは，23日です！飛び入り歓迎．