友人からChemDrawに代わる化学構造式描画ソフト（無料）についての問い合わせがあったので，使用した経験のあるMarvin-Sketchを紹介した．念のため，提供元のHPを調べてみると，いつの間にか個人・非商用利用向けの無料ライセンスの提供は終了していて，アカデミックプランと商用プランだけになっていた．その際，代わりのソフトを探してみたら，EPAM Systemsがブラウザ上で実行可能なKetcherというソフトを提供していることを知った．以下はその利用記録である．

ダウンロードページから最新版を選択すると，Ketcher 2.21.0版の詳細が表示される．Ketcher distributionsからKetcher 2.21.0 standalone を選択する．

ダウンロード

  https://lifescience.opensource.epam.com/download/ketcher/ketcher-2.21.0.html

    1) https://lifescience.opensource.epam.com/downloads/ketcher/ketcher-v2.21.0/ketcher-standalone-2.21.0.zip 👈

   2) https://lifescience.opensource.epam.com/downloads/ketcher/ketcher-v2.21.0/ketcher-remote-2.21.0.zip

   remoteの方がファイルサイズが小さく，standaloneの1/3程度．

インストール

ketcher-standalone-2.21.0.zipを解凍

Ketcher 2.6 remote版もインストールしてみたが，機能面に差はなかった．しかし，リモートには，スタンドアロン バージョンよりもフォーマットオプションが少なくなっている．参考資料

index.htmlをクリックするとブラウザ上にプログラムが展開される．

上下左右にメニューが表示される．上段は入出力など．右端は原子種，左端は各種操作，下端は代表的環状置換基群と構造ライブラリ等が選択できる．ツールアイコンにマウスカーソルを近づけると説明が表示される．

構造ライブラリの例

反応式の描画

保存

17種類のフォーマットが選択可能である．反応式は標準のKetフォーマットで保存する．単分子場合，CMLフォーマットで保存すれば，Avogadro等との連携が可能であり，分子計算用の入力データを作ることができる．ChemDrawとの互換性を保つにはCDXML形式で保存する．画像で保存する場合はPNGフォーマットを選択する．

類似のアプリにくらべて，反応式が書きやすいとの印象を得た．詳細は参考資料を見てほしい．

参考資料

【無料】Ketcherの使い方(インストール&起動)    

Remote version has less save options than the standalone ...

(2024.8.22)