Temario

Semana 1: Fundamentos de la Bioinformática y Herramientas Básicas

Día 1: Introducción a la Bioinformática

• Historia y evolución de la bioinformática

• Aplicaciones en biología y biomedicina

• Recursos y bases de datos biológicas (NCBI, EMBL, DDBJ)

• Actividad: Navegación básica en bases de datos genómicas

Día 2: Biología Molecular para Bioinformáticos

• Dogma central de la biología molecular

• ADN, ARN, proteínas y flujo de información genética

• Actividad: Visualizar secuencias genéticas en GenBank

Día 3: Bases de Datos Biológicas

• Tipos de bases de datos: secuencias, estructuras, expresión génica

• Uso de GenBank, UniProt, Ensembl

• Práctica: Buscar una secuencia de ADN y proteínas paso a paso

Día 4: Alineamiento de Secuencias

• Tipos de alineamiento: local vs global

• Herramientas: BLAST, Clustal Omega

• Actividad: Comparación de secuencias homólogas

Día 5: Análisis Filogenético

• Construcción de árboles filogenéticos

• Introducción a programas como MEGA o PhyML

• Práctica: Análisis de relaciones evolutivas entre genes

Semana 2: Herramientas Avanzadas y Aplicaciones

Día 6: Análisis de Secuencias de ADN y Proteínas

• Predicción de estructura secundaria

• Herramientas como ExPASy, I-TASSER

• Práctica: Predicción de estructuras y dominios funcionales

Día 7: Bases de Datos de Proteínas

• Introducción a UniProt, PDB y Pfam

• Anotación funcional de proteínas

• Práctica: Identificación de familias y dominios proteicos

Día 8: Predicción de Estructura y Función de Proteínas

• Herramientas de modelado de proteínas (Swiss-Model, AlphaFold DB)

• Caracterización de sitios activos y funcionales

• Práctica: Visualización de estructuras en PyMOL o Chimera

Día 9: Interacciones Proteína-Proteína, Proteína-DNA y Bioinformática Estructural

• Introducción al docking molecular

• Herramientas de interacción molécular (ClusPro, H-DOCK)

• Práctica: Análisis de interacciones y complejos proteicos 

Día 10: Visualizadores

• Biovia Discovery Studio, PyMol

• Practica: Analizar las interacciones y reportar las interacciones

• Cierre