Указом Президента России установлена предельная штатная численность Минобороны России в количестве 10 540 человек — ранее 10 400 человек[6] личного состава.

Введение

8 декабря 1991 года, главами трёх союзных республик Б. Н. Ельциным (РСФСР), С. С. Шушкевичем (БССР) и Л. М. Кравчуком (УССР) была подписано Соглашение о создании Содружества Независимых Государств (СНГ) (известное как Беловежское соглашение), где говорилось о прекращении существования Союза Советских Социалистических Республик (СССР) как «субъекта международного права и геополитической реальности». 21 декабря государствами-участниками только что созданного СНГ был подписан протокол о временном возложении на последнего Министра обороны СССР маршала авиации Шапошникова командования Вооружёнными Силами на их территории, в том числе Стратегическими ядерными силами. 14 февраля 1992 года он формально стал Главнокомандующим Объединёнными Вооружёнными Силами СНГ, а 20 марта этого же года МО СССР преобразовано в Главное командование Объединёнными Вооружёнными Силами СНГ (ГК ОВС СНГ, Главкомат ОВС СНГ). Управление Вооружёнными Силами в переходный период до августа 1993 года находилось под управлением Главкомата ОВС СНГ.

В силу особенности организации министерства следует отличать понятия термина Минобороны России:

а) центральный орган исполнительной власти, структурно представляющий из себя административное ведомство — центральный аппарат министерства, главный орган военного управления;

б) система министерства — совокупность формирований и организаций, входящих в структуру министерства.

В системе органов военного управления государства Минобороны России является государственным исполнительным органом государственной администрации, органом управления Вооружёнными Силами Российской Федерации; возглавляется Министром обороны Российской Федерации; подчиняется напрямую Верховному Главнокомандующему Вооружёнными силами Российской Федерации; имеет исполнительные органы в составе органов военного управления, иных органов и подведомственных организаций; является внутригосударственным учреждением, милитаризованным формальным политическим социальным некоммерческим образованием, предоставляющим услуги в области обороны.

Код номерных знаков транспортных средств Минобороны России — 35[7].

Штатная численность гражданского персонала центрального аппарата на 2012 год составляла 2 629 человек[8].

История органа управления (организации, учреждения) государственного военного управления в России берет своё начало от Разрядного приказа (Разряда) и в дальнейшем от иных приказов, в ведении которого были: воинские дела, комплектование рати (войска), строительство крепостей и управление военными силами в южной полосе государства. Разрядные дьяки впервые упоминаются в 1531 году, однако Разрядный приказ в документах встречается с 1535 года.

В начале XVIII века в целях централизации военного руководства в России учреждается Военная коллегия.

20 сентября 1802 года манифестом императора Александра I Военная коллегия преобразуется в Министерство военно-сухопутных сил, которое позже переименовывается в Военное министерство (указом от 24 июля 1808 года). На должность Министра военно-сухопутных сил был назначен вице-президент вошедшей в состав министерства Военной коллегии генерал от инфантерии С. К. Вязмитинов.

В 1812 году в целях укрепления единоначалия и централизации управления войсками были изменены структура и функции Военного министерства. В его составе было образовано семь департаментов: артиллерийский, инженерный, инспекторский, аудиторский, провиантский, комиссариатский, медицинский, а также канцелярия министра и его совет.

В 1815 году Военное министерство вошло в состав Главного штаба Его Императорского Величества. После их разделения в 1816 году оно вновь стало действовать самостоятельно. В 1835 году произошло их новое слияние: Главный штаб Его Императорского Величества вошёл в состав Военного министерства. Руководство всеми частями военного ведомства сосредотачивалось в руках военного министра, и только ему одному разрешалось докладывать о делах лично императору. В 30-е годы XIX века Военное министерство сосредоточило под своим началом все отрасли управления сухопутными силами страны и стало одним из наиболее значимых органов всего государственного аппарата Российской империи. Во многом это было заслугой генерала от кавалерии А. И. Чернышева, возглавлявшего Военное министерство с 1827 по 1852 годы. За всю двухсотлетнюю историю военного ведомства это самый продолжительный срок нахождения в должности военного министра.

К 1836 году Военное министерство состояло из Главного штаба, военного совета, генерал-аудиториата, департаментов Генерального штаба и военных поселений. В 1869 году Военное министерство включало в себя императорскую главную квартиру, военный совет, канцелярию военного министра, Главный штаб и семь главных управлений: артиллерийское, инженерное, интендантское, военно-медицинское, военно-учебных заведений, казачьих войск и военно-судебное. Позднее в состав министерства вошли и другие управления.

Поражение в Крымской войне подтолкнуло правительство Александра II к проведению военных реформ. Руководителем преобразований стал военный министр генерал-фельдмаршал Д. А. Милютин. В результате милютинских реформ 1860—1870 годов в России была сформирована территориальная система военного управления, образованы военные округа. Введение всесословной воинской повинности позволило создать массовую современную армию с обученным резервом. Началось перевооружение новыми образцами оружия, улучшилась подготовка офицерских кадров, были разработаны новые уставы и наставления. Коренным образом изменились и органы центрального военного управления. Победа России над Турцией в войне 1877—1878 годов подтвердила правильность выбранного Военным министерством курса реформ.

После поражения в русско-японской войне 1904—1905 годов, которая вскрыла существенные недостатки в государственном военном управлении, были предприняты меры по его совершенствованию. В 1905 году образован Совет государственной обороны (СГО), объединивший все центральные военные учреждения. В 1909 году СГО был упразднен, а главное управление Генштаба введено в состав Военного министерства. В годы Первой мировой войны в составе Военного министерства были образованы новые управления, в том числе, военно-воздушного флота, по заграничному снабжению. С 1914 года наряду с Военным министерством существовала Ставка Верховного Главнокомандующего. В 1915—1917 годах Военный министр являлся одновременно председателем Особого совещания по обороне — главной организации, осуществляющей мероприятия по обороне страны.

После Октябрьской революции 1917 года Военное министерство было расформировано и образован Наркомат по военным делам во главе с Коллегией. Общее руководство обороной страны и Вооружёнными Силами с ноября 1918 года осуществлял Совет Рабочей и Крестьянской Обороны (с 1923 года — Совет Труда и Обороны). Совет, объединив деятельность двух наркоматов: по военным и по морским делам, разрабатывал и проводил в жизнь планы обороны страны, руководил строительством армии и флота, военными действиями на фронтах.

С другой стороны, в Российском государстве, при правительстве Александра Колчака, было создано Военное министерство для управления вооружёнными силами России: армией, авиацией и флотом[9]. После окончательного завоевания Российского государства большевиками Военное министерство, наряду с другими органами власти, было упразднено.

После окончания Гражданской войны и образования СССР существовавшие раздельно Военный и Морской наркоматы в июле 1923 года были объединены в Наркомат по военным и морским делам СССР. Первым Народным комиссаром по военным делам в Советском Правительстве стал Н. И. Подвойский. С 1918 по 1925 годы во главе военного ведомства находился Л. Д. Троцкий. Стройную структуру система военного управления приобрела при М. В. Фрунзе. Его опыт руководства войсками и организаторские способности позволили существенно повысить эффективность военно-государственного управления, укрепить обороноспособность страны. В 1934 году Наркомат по военным и морским делам постановлением ЦИК и СНК был преобразован в Народный комиссариат обороны СССР. В качестве совещательного органа при нём был создан Военный Совет. В 1937 году из НКО СССР было выделено Управление Военно-Морских Сил РККА и образован самостоятельный Наркомат ВМФ СССР.

С началом Великой Отечественной войны для стратегического руководства Вооружёнными Силами 23 июня 1941 года была образована Ставка Главнокомандования (с 10 июля — Ставка Верховного Командования, с 8 августа — Ставка Верховного Главнокомандования). Руководство обороной страны возглавил И. В. Сталин. Победа в войне с фашистской Германией и милитаристской Японией подтвердила эффективность созданных в стране органов, методов и способов управления вооружённой борьбой.

4 марта 1944 года в соответствии с Законом СССР «О создании войсковых формирований союзных республик и о преобразовании в связи с этим Народного Комиссариата Обороны из общесоюзного в союзно-республиканский Народный Комиссариат» был образован Народный комиссариат обороны РСФСР[10].

В послевоенный период высший орган военного управления играл ведущую роль в оснащении Вооружённых Сил ракетно-ядерным оружием, внедрении современных видов обычных вооружений, создании и развитии новых видов и родов войск. За всем этим стояла напряжённая ежедневная работа руководителей, всех сотрудников Министерства обороны и Генерального штаба Вооружённых Сил.

В феврале 1946 года был создан единый Наркомат Вооружённых Сил СССР, переименованный в марте того же года в Министерство ВС СССР. Также был переименован в министерство и Наркомат обороны РСФСР.

В марте 1948 года Министерство обороны РСФСР было переименовано в Министерство Вооруженных Сил РСФСР[11].

В феврале 1950 года Министерство ВС СССР вновь разделилось на два самостоятельных ведомства — Военное министерство СССР и Военно-морское министерство СССР. Однако, уже в марте 1953 года было создано единое Министерство обороны СССР. Большой вклад в совершенствование системы военного управления в этот период внесли Маршалы Советского Союза А. М. Василевский, Г. К. Жуков, Р. Я. Малиновский, А. А. Гречко, Д. Ф. Устинов.

1 апреля 1953 года Министерство Вооруженных Сил РСФСР переименовано в Министерство обороны РСФСР. Упразднено в 1978 году, поскольку в ст. 73 Конституции СССР 1977 года говорилось, что руководство Вооруженными Силами находится в ведении СССР в лице его высших органов государственной власти и управления, а Министерство обороны СССР согласно ст. 23 Закона СССР от 5 июля 1978 года «О Совете Министров СССР» было отнесено к общесоюзным министерствам[12].

После событий в Вильнюсе 13 января 1991 года, председатель Верховного Совета РСФСР Б. Ельцин выступил с инициативой о создании республиканской армии, и 31 января Госкомитет по общественной безопасности был преобразован в Госкомитет РСФСР по обороне и безопасности, во главе которого встал генерал армии К. И. Кобец. 5 мая 1991 года госкомитет был разделен на Госкомитет РСФСР по делам обороны и КГБ РСФСР. 30 июля Государственный комитет по делам обороны переименован в Государственный комитет по оборонным вопросам.

С 19 августа по 9 сентября из-за выступления ГКЧП временно существовала должность Министра обороны РСФСР[13].

6 ноября 1991 года указом Президента РСФСР № 172 была утверждена структура Правительства, в которой предусматривалось существование Министерства обороны РСФСР[14]. Постановлением Правительства РСФСР № 3 от 13 ноября 1991 года до образования республиканского Министерства обороны Государственный комитет РСФСР по оборонным вопросам временно включен в структуру Правительства РСФСР.

В связи с распадом (развалом) Советского Союза и в соответствии с Соглашением глав государств — участников Содружества Независимых Государств от 20 марта 1992 года образовано Главное командование Объединённых Вооружённых Сил СНГ, с 1993 года — Штаб по координации военного сотрудничества государств — участников СНГ). 16 марта 1992 года на базе Министерства обороны СССР^[источник не указан 920 дней^] указом Президента Российской Федерации было создано Министерство обороны Российской Федерации. В настоящее время Минобороны России является федеральным органом исполнительной власти, который проводит государственную политику, осуществляет государственное управление в области обороны, а также координирует деятельность федеральных министерств, иных федеральных органов исполнительной власти субъектов России по вопросам обороны.

15 февраля 2007 года Министром обороны Российской Федерации был назначен А. Э. Сердюков. С именем А. Сердюкова связан запуск кардинальной реформы Вооружённых Сил России, придание им «нового облика». Катализатором, ускорившим принятие решение о реформе, стал военный конфликт с Грузией в августе 2008 года[15]. Опыт участия российских Вооружённых Сил в конфликте выявил массу проблем, связанных как с недостатками системы управления войсками, так и с устаревшим вооружением, снаряжением и средствами связи[16]. Официально о начале реформы Анатолием Сердюковым было объявлено 14 октября 2008 года по завершении коллегии Министерства обороны России. Изменения коснулись всех основных элементов Вооружённых Сил России[17]