Стратегія розумної спеціалізації в ЄС, в якості методу регіонального інноваційного розвитку використовувалася раніше незалежно від Рамкової програми з досліджень та інновацій. Головним джерелом фінансування регіонального інноваційного розвитку були Структурні фонди ЄС в рамках стратегії Єднання та інклюзивного зростання. Більше того, одночасне фінансування одного проекту Рамковою програмою та структурними фондами не дозволялося. Програма Горизонт 2020 не тільки дозволяє в певних проектах часткове використання одночасного фінансування структурними фондами, наприклад інфраструктури, але й включає до вимог конкурсу узгодженість проекту із Стратегіями розумної спеціалізації країн – учасників. Незважаючи на те, що Україна, як Асоційована країна, не має доступу до структурних фондів ЄС, але вона може претендувати на підтримку інших фондів, що зараз впроваджуються в ЄС для підтримки співробітництва з країнами-сусідами. Наприклад, 25 вересня 2017 року створюється Європейський фонд сталого розвитку для реалізації ЄС зовнішніх інвестицій для країн Африки та країн – сусідів.