Atanasijus Kirher je ulozio velike napore da procita hijeroglifske natpise prvenstveno one na egipatskim obeliscima u Rimu, ti njegovi radovi su bili najopsezniji u Evropi pre desifrovanja.
Zahvaljujuci rukopisima koje su sakupili Nikolas-Klod Fabri de Peiresc i Pjetro dela Vale , Kirher je znacajno uspeo u citanju koptskog , poslednjoj izvornoj formi egipatskog jezika, pisanoj grckim pismom.Onda je skrenuo u proucavanje hijeroglifa gde je njegovo delo fatalno kompromitovalo njegovo drzanje ideje o ezotericnoj i simbolicnoj prirodi egipatskog pisma, koju je on iznova i iznova ponavljao u mnogim svojim publikacijama.
Knjige Atanasijusa Kirhera o egipatskim hijeroglifima sadrze bogat asortiman ilustracija antikviteta sakupljenih sa svih strana Evrope.
Medju stranicama njegovog dela o Egiptu nalazila se i tablica alfabetskih slova iz drevnih jezika, ukljucujci i nebeske alfabete.Takodje u svom delu Kirher tumaci i nadogradjuje ideju Dzona Dija o znacenju egipatskog skarabeja i tumaci da skarabej predstavlja kosmicki duh.Kirher gradi sliku skarabeja koji se krece spiralnim putem, sa leve strane su solarne muske planete, a sa desne strane su lunarne zenske planete a sam skarabej koji se krece po toj uzlaznoj spirali simbolise i predstavlja sam kosmicki duh.
Kirher je izgubio primat koji je drzao tokom zivota, onu reputaciju stecenu svojim specificnim teorijama o desifrovanju egipatskih hijeroglifa, koje su se odrzale sve do desifrovanja hijeroglifa u XIX veku, a sto je bio najtrajniji vid njegovog uticaja.
Kirher je otac Egiptologije sakupio je pravi arheoloski materijal uprkos mnogim greskama njegov je ogroman doprinos i znacaj Egiptologiji, vise od 150 godina kasnije Sampolion je koristio Kirherovu rekonstrukciju za proucavnje obeliska koji stoji na na rimskoj Pjaca Navoni.Za Kirhera hijeroglifi su bili bozanskog porekla zato sto su predstavljali nepoznatu i misterioznu sustinu stvari.Za Kirhera stari Egipat iako je nestao, cela njegova mudrost je postala deo hriscanske civilizacije, tako da su njeni tekstovi bili sveti.