さらに、ＤＮＡ配列に変化を及ぼさず、遺伝子の働きを制御する仕組みの全体をさす「エピゲノム」、実際の遺伝子の働き（遺伝子発現）全体である「トランスクリプトーム」を同時に解析します。これらを実現するために、ＤＮＡ配列を読み解くシークエンス技術を用います。実験でがん細胞のゲノム・エピゲノム・トランスクリプトーム情報を取得し、スパコンなどの大規模計算機環境を用いて解析を行うため、分子生物学実験と情報解析の両方に精力的に取り組むことが必要となります。最終的には、がん細胞の中で何が生じているのか知ることで、新しい治療標的、診断マーカーにつなげることを目指しています。