在蔣氏家族的政權因蔣經國去世而結束之後,整個國民黨內起了巨大變化,李登輝副總統雖然順利繼任,但是這些當初只對蔣氏家族效忠的舊勢力,面對了毫無淵源、不具蔣氏家族正統的全新國家領導人,卻絕不可能會完全效忠認同。一時之間,在調查局的內部反應相當極端,高層的長官開始無所事事,每天打算著如何累積財富,安排退休後的生活,基層外勤調查員也逐漸自我放逐,由於工作上的職權接觸,慢慢也發展出自己的生財之道,又因為高層的約束力量鬆散,一種糾纏勾結、黑白難分的利益共生體便漸漸的成形。
在政治的高層中,國民黨內部的權勢角力無日或止,李登輝總統飽受著各情治單位的明爭暗鬥。當時最明顯的一件事,就是在每週三國民黨的中常會開完之後,下午在忠孝東路的頂好大樓樓上,還有另外一場「真正的中常會」,這些能實際掌握政府運作大權的頭子們,又秘密的聚在一起開會,那才是一場真正可以決定台灣重大政策方向的會議,也是這些特務巨頭們交換濫權營私之心得的俱樂部。那時期「政要」們的黑頭轎車一輛接一輛到達,每個人都從秘密的後門進入電梯,一個沒有總統主持的「地下總統府會議」就在那裡開起來。後來終於被總統府高層發現以後,就又搬到更隱密的地方去了。這些情治黨巨頭的秘密聯繫情形,一直都沒有間斷過。我們可以相當肯定的推斷,在台灣所有的政爭事件當中,都是完全由情治黨在當中介入操盤。