• Tallinna • Lilleküla • Tondi • Järve • Rahumäe • Nõmme • Hiiu • Kivimäe • Pääsküla • Laagri • Urda • Padula • Saue • Valingu • Keila • Niitvälja • Klooga • Klooga-aedlinn • Põllküla • Laoküla • Paldiski
•• Klooga • Kloogaranna
•• Keila • Kulna • Vasalemma • Kibuna • Laitse • Jaanika • Riisipere • Turba [• Ellamaa • Risti • Palivere • Nigula • Taebla • Ridala • Uuemõisa • Haapsalu] (hakasulkeissa oleville asemille Riisiperestä Haapsaluun ei liikennöidä – eikä rataosalla ole tällä hetkellä kiskojakaan)
• Tallinna • Kitseküla • Ülemiste • Vesse • Lagedi • Kulli • Aruküla • Raasiku • Parila • Kehra • Lahinguvälja • Mustjõe • Aegviidu • Nelijärve • Jäneda • Lehtse • Tapa •• Nõmmküla • Tamsalu • Kiltsi • Rakke • Vägeva • Pedja • Jõgeva • Kaarepere • Tabivere • Kärkna • Tartto
•• Tapa • Udriku • Kadrina • Rakvere • Vaeküla • Kabala • Sonda • Kiviõli • Püssi • Kohtla-Nõmme • Kohtla • Jõhvi • Toila • Oru • Vaivara • Auvere • Soldina • Narva
• Tartto • Aardla • Ropka • Nõo • Tõravere • Peedu • Elva • Palupera • Puka • Mägiste • Keeni • Sangaste • Valga
• Koidula • Piusa • Lepassaare • Otsa • Võru • Somerpalu • Kurenurme • Antsla • Karula • Valga
Kapearaiteinen rata Raplasta Virtsun satamaan palveli vuosina 1931-1968. Rata on purettu, mutta sen asemat ovat suurelta osin säilyneet:
• Rapla • Raiküla • Koikse • Pühatu • Märjamaa • Paeküla • Vigala • Rumba • Rootsi • Kirbla • Lihula • Tuudi • Karuse • Virtsu
Kapearaiteinen rata Viljandista etelään palveli vuosina 1897-1973. Rata on purettu, mutta sen asemat ovat suurelta osin säilyneet:
• Viljandi • Sinialliku • Loodi • Kaarli • Halliste • Abja • Mõisaküla • Kilingi-Nõmme • Surju • Vaskrääma • Pärnu
Kapearaiteinen haararata Viljandin radan Türistä Paideen valmistui vuonna 1900 ja Paidesta edelleen Tarton radan Tamsaluun vuonna 1920. Liikenne loppui vuonna 1972. Rata on purettu, mutta sen asemat ovat suurelta osin säilyneet:
• Türi • Paide • Vodja • Esna • Järva-Jaani • Vajangu • Tamsalu