«Основные биологические образы на двух языках»
Состояние магистерской диссертации за год до защиты
Подвойская Ия Вадимовна
(Планируемое) содержание работы
Введение
Глава 1.
Глава 2.
…
Заключение и выводы
Литература
Введение
Образы биологические в разных языках, т.е. одни и те же процессы, на разных языках называют по-разному. Вымывание русского языка из биологии. Десятки лет русскоязычная биология не развивалась, поэтому приходится пользоваться кальками. Русский язык и санскрит очень образные, выразительные, новые объёмные понятия лучше создавать на образном языке. Само развитие языка на это влияет, имеет очень древнее происхождение. Английский язык подходит менее. Молекулярная биология почти ничего не дала, т.к. в основе лежала идея неизменности гена. Русский язык включает в себя содержательные, больше многозначных, образных слов, сразу отражающих одновременно разные стороны процесса. Слово "образность" по словарю Ушакова: «1. Отвлеч. сущ. к образный. Образность выражения. Образность речи. 2. Система образной речи, образного построения (лит.). Образность - один из основных признаков художественного произведения. Ѓ Живость, красочность изображения. Речь его отличалась образностью». По словарю В.И. Даля: «Ображать, давать вид, образ; обтесывать или слагать, составляя нечто целое, отдельное». На английском языке «образность» - «figurativeness, imagery, picturesqueness (живость, яркость)» [ABBYY Lingvo x5]. Figurativeness происходит от figure 1) фигура (человека); телосложение; внешние очертания, форма тела; 2) внешний вид; облик, образ; производимое впечатление; 3) личность, фигура Syn: person , personage , character , notable , eminence 4) изображение фигуры человека; статуя; портрет - action figure 5) иллюстрация, рисунок (в книге и т. П.) ; узор (на ткани, бумаге) ; диаграмма, чертёж Syn: diagram , illustration , drawing , pattern , design 6) эмблема, символ Syn: emblem , sign , symbol; 7) фигура (речи) - figure of speech; 8) фигура (в танцах, фигурном катании, полёте в воздухе и т. П.); 9) ритмико-мелодический элемент, украшающий музыкальное произведение; 10) фигура, тело; 11) гороскоп; 12) цифра Syn: digit , number , cipher , numeral; 13) figures цифровые данные; 14) вычисления Syn: sum , calculation , computation; 15) цена [ABBYY Lingvo x5].
Существует гипотеза [?], что чем более формализован язык, тем менее он образен. Зачем все это: 20 лет, созидать, сделать вклад в развитие парадигмы экспрессии. Процесс созидания на русском языке. Вернадский, Флоренский, Кольцов, Тимофеев-Ресовский - уникальные люди, которые говорили и писали на русском языке. Образы, которые вложены в биологические процессы, можно выразить на любом языке.
Предположение: Смысл гена зарыт не только в последовательности оснований этого гена, он в самом процессе его чтении, его экспрессии. Следовательно, я могу предположить, что генетика тесно перекликается с лингвистикой, семиотикой (о чем свидетельствует появление биосемиотики как отдельной области знания) и может использовать инструменты и методы данных наук для саморазвития [pivth1].
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы. Наука подошла вплотную к формулировке основных законов современной биологии благодаря колоссальным по значимости и глубине открытиям в последние годы. Частью этой проблемы является теоретические принципы, которые могут служить основой формулировки фундаментальных законов биологии. В работе выбраны ключевые слова для создания правильных образов с помощью сравнительного анализа основных понятий современной биологии на русском и английском языках.
Степень разработанности проблемы поиска закономерностей и теоретических принципов развития биологических систем определяется результатами работ, которые пока читаются, конспектируются и анализируются.
Цель и задачи исследования. Главной целью работы было понять принципы клеточной биологии и разобраться в основных биологических понятиях, на которых построена современная биология.
Из основной проблемы вытекали следующие задачи:
Выбрать методику и основные ключевые слова, для которых в английском и русском языках нет адекватных терминов, т.к. используются лишь «кальки».
Разработка модели основных образов.
Применение созданных моделей для анализа известных принципов биологии.
Научная новизна. В работе впервые показано, что:
Доказано, что …
При взаимодействии …
На основе анализа основных биологических образов было показано …
Основные положения, выносимые на защиту.
Методы теоретического описания биологических образов на двух языках приведены в соответствие. Этим путём удалены «кальки» (перечислить) и предложены уточнённые рабочие формулировки терминов (перечислить).
Развитые модели основных образов (перечислить) можно применить в …
Достоверность результатов обеспечивалась (тут напишу лаконично и доказательно, но позже)
Научная и практическая значимость работы состоит в том, что...
принципиальные моменты основных результатов работы …
Апробация работы. Материалы диссертации докладывались на … а также на научных семинарах ведущих лабораторий по теме диссертации.
Публикации. Результаты диссертации опубликованы в Х работах, основные из которых будут представлены в автореферате в списке литературы под номерами А_1-А_Х, и в Y тезисах конференций, главные из которых указаны выше. Рабочий список литературы моей диссертации представлен в конце этого файла.
Личный вклад автора состоял (скажу точно, чтобы не обижать соавторов)
Структура и объем работы. Диссертация будет состоять из введения, Х глав, заключения и выводов. Объем диссертации ХХХ страниц, включая ХХ рисунков, ХХ таблиц и список цитируемой литературы из YYY наименований на ZZ стр.
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ
Параграф #? v0 in Глава № piv1v0.
Это пока заготовки, которые в дальнейшем объединю в логически связанном содержании работы.
Значение современных концепций и методологий в естествознании.
Значение биологии для человечества. Н.В. Тимофеев-Ресовский (конспект [piv207])
Предмет физики в сравнении с предметом биологии — 1) изучает более простой, чем биологи объект: наука счастливая в том отношении, что гетерогенная комплексность подлежащего ее исследованию материала значительно меньше, чем в биологии, и даже, пожалуй, меньше, чем в химии. 2) имеет дело и опирается на универсальные законы природы, следовательно, к биологическим объектам приложимы физические законы. Comment [piv]: Т.е. к биологическим явлениям применимы физические законы, но применимы ли биологические законы к физическим, если объект физики проще?
Проблемы современной автору (20 века) биологии:
1. Большинство самых нормальных не ретроградных, а просто хороших биологов в смысле общих своих концепций и методологических естественно-исторических установок до сих пор работают с точек зрения примерно двухсотлетней давности. Comment: и на сегодняшний день проблема методологии биологии не решена.
2. Из-за отсутствия у биологов, особенно у прикладных, серьезного понимания методологии и методики применения математической статистики огромное количество опытов неправильно планируется с самого начала в смысле расчета объема опытов и затрат сил. Неправильно обрабатываются и результаты.
3. Неупорядоченность и разрозненность биологической информации. Так же как химия не могла бы развиваться, если бы люди не узнали, какие элементы и химические соединения водятся на нашей планете, так и биологам в первую очередь надо знать материал, подлежащий изучению. Comment: не плохо бы создать в биологии свою «периодическую таблицу», как в химии. Думаю, такая таблица будет только не 2-мерной, а как минимум трехмерной.
Как вводятся новые концепции и как соотносятся со старыми: Старые концепции на поверку обычно оказываются частным случаем этих новых концепций, то есть поле их действия меньше поля действия новых концепций. Например: для физики - Ньютоновская механика сегодня. А вот в биологии сознательной методологической работы в этом смысле до сих пор не производится. Хотя в биологии в ХХ веке произошло нечто аналогичное физике: создание хромосомной теории наследственности и развития биофизической части радиационной генетики. И методологически здесь
имеется много параллельного и взаимо-(?)-интересного.
Хромосомная теория наследственности и молекулярная биология. Многие биологические явления могут трактоваться сегодня с точки зрения вот этого биологического микромира — с точки зрения основных, исходных управляющих матриц, управляющих систем, с которых, так сказать, начинается биологическое рассуждение.
Единственным специфически биологическим является дарвиновский принцип отбора. Потому что другой принцип — всеобщий биологический принцип конвариантной редупликации, или идентичного воспроизведения, — подлежит физическому объяснению.
Новой концепцией в биологии является та сумма знаний, представлений и вычлененных общих принципов, которые связаны с развитием хромосомной теории наследственности и, вытекающей из нее молекулярной биологии.
Как эволюционируют биологические системы во времени?
Можно эволюционные проблемы рассматривать с точки зрения хоботов, хвостов, крокодильих зубов и так далее. То есть с точки зрения макробиологических структур. Но как во времени протекает онтогенез, как из нуклеиново-кислотного кода получается слон или крокодил? Индивид, слон № 17 или крокодил № 35, — это проблема онтогенеза. Когда-то, в прошлом веке, жил крокодил № 17, а в этом веке живет крокодил № 187, уже совершенно другой крокодил, и что осталось? Остался «крокодилизм». Вот то, о чем говорил Платон (!!!): что дураки очень хорошо понимают, что такое лошадь, но «лошадности» они не понимают. «Крокодилизм» - это некий тип исходных управляющих систем. Во времени «крокодилизм» существует в форме определенных кодов наследственной информации. И совершенно естественно, что эволюционное значение имеет не то, что изменилось у крокодила № 17, например, а то, что изменилось в «крокодилизме». Проблему нужно поставить с головы на ноги. Не с крокодильего хвоста, а с того, что во времени поддерживает существование крокодильих хвостов, — соответствующих кодов информации, которые определяют специфическую совокупность признаков.
Для чего нужно комплексное, всестороннее развитие биологии? Значение биологии для человечества.
Человечеству, пребывающему в огромной численности, предстоит в предвидимом будущем решать проблему повышения средней скорости биологического круговорота биосферы, перестройки биогеоценозов в биосфере Земли таким образом, чтобы на пару порядков величин повысить подлежащую изъятию биомассу из биосферы и замедлить процессы биологического исчезновения биосферной продукции, то есть перехода в осадочные горные породы — минерализации. Замедлить превращение в значительно менее ценное для человека вещество отмирающей части биомассы биосферы.
Источник [piv207],
Параграф #? v0 in Глава № piv2v0.
Список основных понятий магистерской диссертации Подвойской И.В.
Define: piv key words = pikw01 -:- pikw99
1. Gene - Ген * N = genome геном – не статическое образование. Ген (по Подвойской) - это абзац из текста огромного и бесконечно подробного руководства пользователя "биокомпьютером", и текст этот постоянно записывается и читается на языке природы и её средствами в процессе экспрессии. (# ) pikw01
Размер генома: E. coli 5 Mbp;
S. cerevisiae (дрожжи) 12 Mbp;
C. elegans (нематода) 100 Mbp;
D. melanogaster (дрозофила) 120 Mbp;
A. thaliana (арабидопсис) 120 Mbp;
M. musculus (мышь) 2.5 Gbp;
H. sapiens (человек) 2.9 Gbp;
T. aestivum (пшеница) 16 Gbp
2. Expression - Экспрессия - экспрессом
- как танец балерины, произведение композитора, выражает то, что есть только у него; выражение геномом самого себя, но в клетке. Не гены экспрессируются – экспрессируется взаимодействие статической ДНК и динамической РНК [pit]. (# ) pikw02
3. Translation - Трансляция – процесс, посредством которого рибосома декодирует информацию, которая содержится в мРНК, чтобы синтезировать белок. Скорость трансляции рибосомой 10-20 аминокислот/с (# ) pikw03
4. Transcription - Транскрипция – ферментативный процесс, посредством которого РНК полимераза использует образец ДНК, чтобы управлять полимеризацией РНК из рибонуклеозид трифосфата предшественника. Скорость транскрипции РНК-полимеразой 10-100 оснований/с (# ) pikw04
5. Transcriptome - Транскриптом – совокупность транскриптов в том или ином организме. (# ) pikw05
6. Transcript -Транскрипт – РНК, образовавшаяся в результате транскрипции ДНК [Альбертс]. (# ) pikw06
7. Replication - Репликация – копирование молекулы ДНК. Скорость репликации ДНК-полимеразой E. coli 200 – 1000 оснований/с; человек - 40 оснований/с. Скорость мутаций при репликации ДНК 10-8–10-10 на пару оснований (# ) pikw07
8. Enhancer – Энхансер – «подпорка», увеличитель уровня транскрипции гена (# ) pikw08
9. Splicing - Сплайсинг – «прополка грядок» - удаление интронов из транскрипта. (# ) pikw09
10. Spliceosome - Сплайсеосома – большое собрание рибонуклеобелков, которое катализирует удаление пре-мРНК интронов и связывает экзоны вместе для образования зрелой мРНК. (# ) pikw10
11. Interactomic - Интерактомика. Биологическое взаимодействие. Между клетками, внутри клеток между молекулами, между тканями, между людьми. (# ) pikw11
12. Read-write genome [James Shapiro, piv246] – геном как система чтения-записи информации. (# ) pikw12
13. Intron – интрон – помогает экзонам тасоваться и располагать их в пространстве. (# ) pikw13
14. Exon – экзон – содержит значимую (?) информацию. (# ) pikw14
15. DNA methylation - Метилирование ДНК (# ) pikw15
16. Усиление биологическое – амплификация (amplification), усилитель биологический, энхансер () (# ) pikw16
17. (# ) pikw17
18. (# ) pikw18
19. (# ) pikw19
20. (# ) pikw20
Параграф #? v0 in Глава № piv3v0.
Биосемиотика как наука. Этапы развития.
Разделы.
Параграф #? v0 in Глава № piv4v0.
Благодарности. Благодарю П.И. Белоброва за редактирование этого текста и за идею магистерской диссертации.
Источники in my pivLib
По методологии биологии и общим и частным понятиям (для словаря):
· Албертс Б. и др. Молекулярная биология клетки. Издательство: R&D Dynamics, 2013. 2821 с. Это перевод 5-го издания 2008 года. Есть 6-е издание [piv242] (# ) piv201
· Волькенштейн М. В. Молекулярная биофизика. М.: Наука, 1975. - 616 с. [pit856 ?] (# ) piv202
· Волькенштейн М. В. Общая биофизика. М.: Наука, 1978. - 592 с. (# ) piv203
· Льюин Б. Клетки, пер. под редакцией Ю.С. Ченцова 2011, 951 с. Есть 3-е английское издание 2015 года [piv212] (# ) piv204
· Льюин Б. Гены. Бином. Лаборатория знаний. 2012, 896 с. (# ) piv205
· Талеб Н.Н. Антихрупкость. Как извлечь выгоду из хаоса. 2014. 367 с. (# ) piv206
· Тимофеев-Ресовский Н.В. Генетика, эволюция, значение методологии в естествознании. Лекции, прочитанные в Свердловске в 1964 году. — Екатеринбург: Токмас-Пресс, 2009. — 240 с. (# ) piv207
· Шредингер Э. Что такое жизнь? Москва-Ижевск : НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика", 2002. - 92 с. (# ) piv208
· Alberts Bruce, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Essential Cell Biology, 4th Ed. 2014. 865 p. (# ) piv209
· Ludwig von Bertalanffy. Modern theories of development: an introduction to theoretical biology. OUP. 1933. 214 p. тот самый Людвиг фон Берталанфи, который начинал как эмбриолог, но потерпев неудачи при построении теоретической биологии, создал знаменитую «Теорию систем». Удивительно, что другой эмбриолог Уоддингтон в 60-е годы прошлого века также обратился к попыткам построения теоретической биологии. Результаты его усилий были опубликованы в «Towardtheoretical biology. Prolegomena». (# ) piv210
· Milo Ron, Paul Jorgensen, Uri Moran, Griffin Weber, and Michael Springer. BioNumbers—the database of key numbers in molecular and cell biology // Nucl. Acids Res. (2010) (# ) piv211
· Phillips Rob, Jane Kondev, Julie Theriot, Nigel Orme, Herman Garcia. Physical biology of the cell [2 nd.] Garland Science. 2013. ~1040 p. (# ) piv212
· Plopper G.; Sharp D.; Sikorski E.; Lewin B. Lewin's Cells [3rd ed.], 2015. 1056 p. (# ) piv213
· Plopper G. Principles of Cell Biology. 2nd Ed. 2016. 566 p. (# ) piv214
· http://bionumbers.hms.harvard.edu/(# ) piv215
Дендроэкология:
· Briffa, K. R., and Jones, P. D. 1990. Measuring the statistical quality of a chronology // In: Methods of dendrochronology: applicationsin the environmental sciences (Ed. by E. R. Cook and L. A. Kairiukstis). – Boston, Mass., USA: Kluwer Academic Publishers. – P. 137–152. (# ) piv217
· Douglass A. E. Climatic cycles and tree–growth. A study of the annual rings of trees in relation to climate and solar activity. – Washington: Carnegie Inst., 1919. Vol. 1. – 127 p. (# ) piv218
· Fritts H. G. Tree–ring and climate. – New York: Academic Press, 1976. – 567 p. (# ) piv219
· Schulman E. Dendroclimatic changes in semiarid America. – Tucson, Arizona: University of Arizona Press, 1956. – 142 p. (# ) piv220
· O’Connor et al. Human Pyrogeography: A New Synergy of Fire, Climate and People is Reshaping Ecosystems across the Globe. Geography Compass 5/6 (2011): 329–350. (# ) piv221
· Schweingruber, F. H., Eckstein D., Serre-Bachet F. and Bräker O. U. Identification, presentation and interpretation of event years and pointer years in Dendrochronology // Dendrochronologia. – 1990. – Vol. 8. – P. 9–39. (# ) piv222
· Swetnam Thomas W., Baisan Christopher H., Caprio Anthony C., Brown Peter M., TouchanRamzi, Anderson R. Scott, and Hallett Douglas J. Multi-Millennial Fire History Of The Giant Forest, Sequoia National Park, California, USA. Fire Ecology Vol. 5, No. 3, 2009. (# ) piv223
· Vaganov E.A., Hughes M.K., and Shashkin A.V. Growth dynamics of conifer tree rings: images of past and future environments. (# ) piv224
· Wigley T. M. L., Briffa K. R., Jones P. D. On the average value of correlated time series, with applications in dendrochronology and hydrometeorology // J. of Climate and Applied Meteorology. – 1984. – Vol. 23. – P. 201–213. (# ) piv225
· Дендроэкология (методикадревесно-кольцевогоанализа) / Д.В. Тишин. – Казань: Казанский университет, 2011. – 33 с. (# ) piv226
· Рост и структура годичных колец хвойных / Е.А. Ваганов, А.В. Шашкин. – Новосибирск: Нука, 2000. – 232 с. (# ) piv227
Научный английский язык:
· Bailey, Stephen. Academic Writing.A Handbook for International Students.3rd ed. Rourladge. 2011. (# ) piv228
· Cargill, Margaret; O’Connor, Patrick. Writing Scientific Research Articles.Strategy and Steps.Wiley Blackwell. 2009. (# ) piv229
· Day Robert A. How to write and publish a scientific paper.5th ed. ORYX Press, 1998. (# ) piv230
· Day, Robert A., Sacaduski, Nancy. Scientific English.A Guide for Scientists and Other Professionals.3rd ed. Greenwood. 2011. (# ) piv231
· Dodd, Janet S. The American Chemical Society Style Guide.A Manual for Authors and Editors. Washington, DC, 1986. (# ) piv232
· Glasman-Deal, Hilary. Science Research Writing for Non-Native Speakers of English. Imperial College Press, London, 2010. (# ) piv233
· Hogue, Ann. First steps in academic writing. 2nd ed. Pearson, 2008. (# ) piv234
· Lindsay, David. Scientific Writing = Thinking in Words. CSIRO Publishing. 2011. (# ) piv235
· Porter, David. Check Your Vocabulary for Academic English. Macmillan Publishers Ltd., 2008. (# ) piv236
· Tamzen Armer, Jeremy Day. Cambridge English for scientists. Cambridge: Cambridge University Press, 2011. - 108 p. (# ) piv237
· English for Academic Purposes. Writing essays: Сб. Текстов и упражнений по развитию навыков письменной речи на английском языке для студентов дневной формы обучения / сост.: М.В. Савельева, О.В. Маслова, Т.В. Стрекалева, А.Н. Ткачук, А.Е.Гончаров; СибГАУ, Красноярск, 2009. - 80 с. (# ) piv238
· English for Science. Grades 10-11. O. Groza, V. Guseynova, T. Ryzhkova, E. Skuratovich, Krasnoyarsk, SFU, 2007. (# ) piv239
· Михельсон Т.Н., Успенская Н.В. Как писать по-английски научные статьи, рефераты и рецензии, «Специальная литература», СПб.,1995. (# ) piv240
· Свидерская И.В., Кратасюк В.А. Как написать и опубликовать статью в международном научном журнале. Методические указания, Сиб. Федерал. Ун-т, Красноярск, 2011, 52 с. (# ) piv241
Пропущенные и дополнительные текущие ссылки
· Alberts 6th Edition see [piv201] (# ) piv242
· Якоб Иоганн фон Икскюль нем. URL Jakob von Uexküll. Theoretical Biology. Harcourt, Brace, & Co. 1926. 190 p. [http://tbio.molpit.ru/home/von-uexkuell] (# ) piv243
· Теоретическая биология BioTheory http://tbio.molpit.ru/ (# ) piv244
· Кроме [piv214] есть ещё принципы Дениса Нобла, Ефима Либермана и др., часть которых была изложена в лекциях ПИ (# ) piv245
· J Shapiro to add (# ) piv246
· (# ) piv247
Биосемиотика – относительно молодая, но очень интенсивно развивающаяся область
· Кулль К. Семиотический поворот в биологии и биологический поворот в семиотике. Предвременная биосемиотика [URL] (PPT-файл, 6.1 Мб), размещено на сайте 05.05.2009 (# ) piv248
· Странная ссылка http://biospace.nw.ru/biosemiotika/main/biosem.htm (# ) piv249
· Ещё http://biospace.nw.ru/biosemiotika/main/interevent.htm (# ) piv250
· Biosemiotics https://en.wikipedia.org/wiki/Biosemiotics (# ) piv251
· Биосемиотика https://ru.wikipedia.org/wiki/Биосемиотика (# ) piv253