"Трудная дорога в дюнах" завершена. Подготовка и сдача экзамена «Физическая биология клетки» по книгам:
• Rob Phillips, Jane Kondev, Julie Theriot, Nigel Orme, Herman Garcia. Physical biology of the cell. [2nd ed.] Garland Science. 2013. ~1040 p.
• Ron Milo and Rob Phillips. Cell Biology by the Numbers. Draft JULY 2015
• Т. Уэй. Физические основы молекулярной биологии: Учебное пособие. 2010. 368 с.
Билет 1.
1.1. Основные направления количественной биология клетки
1.2. Характеристики нейронов и синапсов
1.3. Сколько различных генов в грамме почвы, навоза и воды океана?
Билет 2.
2.1. Где расположены планы формирования клеток и организмов
2.2. Строгие правила небрежных расчетов «на салфетке»
2.3. Что такое разнообразие антител в организме человека?
Билет 3.
3.1. Физическое и биологическое время в клетках
3.2. Как работают секундомеры на масштабах клеток и тканей
3.3. Как быстро тикают молекулярные часы?
Билет 4.
4.1. Модельные молекулы и организмы для физики клетки
4.2. Насколько длинными могут быть аксоны
4.3. Как быстро происходит передача сигнала в клетке?
Билет 5.
5.1. Механическое и химическое равновесие в живой клетке
5.2. Каковы скорости соматического рекомбинации и транспозиции?
5.3. Этапы клеточного цикла и их относительные длительности
Билет 6.
6.1. Правила энтропии для клеточных процессов
6.2. Насколько велики осмотическое давление и тургор в клетках?
6.3. Масштабы тепловой энергии и их отношение к биологии
Билет 7.
7.1. От состояний ионных каналов к кооперативному связыванию
7.2. Скорость посттрансляционной модификации белков
7.3. Сколько белков синтезируется за одну трансляцию мРНК?
Билет 8.
8.1. Случайные блуждания и структура макромолекул
8.2. Как генетически похожи два случайных человека?
8.3. Что такое энергия, затраченная на усвоение углерода и азота?
Билет 9.
9.1. Электростатика соленых растворов
9.2. Сколько типов клеток есть в человеческом теле?
9.3. Сколько путей фиксация углерода существует в природе?
Билет 10.
10.1. Цитоскелет и архитектоника клеток
10.2. Пространственные структуры клеток и тканей
10.3. Насколько длинные некодирующие РНК?
Билет 11.
11.1. Биологические мембраны: жизнь в двух измерениях
11.2. Как быстро сигнал распространяется от рецептора к ядру?
11.3. Размеры отверстий в мембранах клеток
Билет 12.
12.1. Математика и физика воды
12.2. Каковы типичные скорости полимеризации РНК и белков?
12.3. Особенности растительных клеток и их органелл
Билет 13.
13.1. Статистический взгляд на биологическую динамику
13.2. Рождение доминанты при взаимодействии клеток
13.3. Каковы концентрации некодирующих РНК?
Билет 14.
14.1. Жизнь в переполненных и неупорядоченных средах
14.2. Каковы максимальные темпы роста различных организмов?
14.3. Какова скорость сворачивания белка?
Билет 15.
15.1. Динамики молекулярных моторов в клетке
15.2. Какие усилия могут создавать молекулярные моторы?
15.3. Сколько каждого типа органелл существует в клетке?
Билет 16.
16.1. Биологическое электричество и модель Ходжкина-Хаксли
16.2. Какое количество нейронов в головном мозге?
16.3. Величины затрат энергии на перестройки мембран
Билет 17.
17.1. Сравнение бактериальных, растительных и животных клетки
17.2. Свет и жизнь на примерах фотосинтеза и биолюминесценции
17.3. Апоптоз, программирование и перепрограммирование клеток
Билет 18.
18.1. Организация биологических сетей и деревьев
18.2. Какая доля рРНК в рибосоме?
18.3. Биологическое разнообразие и его роль в симбиогенезе
Билет 19.
19.1. Биологические паттерны в пространстве и во времени
19.2. Что такое частота ошибки при узнавании антител?
19.3. Врожденный и адаптивный иммунитеты в симбиозах
Билет 20.
20.1. Длина последовательности для гомологичной рекомбинации
20.2. Роль специфичности при биологических взаимодействиях
20.3. Доказательства биологической эволюции и логика случая
Билет 21.
21.1. Основные достижения физической биологии клетки
21.2. Сколько сахара надо для создания клетки и её работы?
21.3. Особенности коллективного поведения клеток в эмбриогенезе
Ответы на все вопросы есть в трёх указанных выше книгах!