Fiji, ImageJのメモ。ちょっとずつ勉強中。
http://lpixel.net/download/141003-0915.pdf
1. コマンド
1-1. Pluginのインストール
ダウンロードした XXX.jar ファイルを Fiji の jar フォルダに入れる。
Fiji/ImageJ を立ち上げ
Plugins > Install Plugins でファイルを選びインストール。
Fiji/ImageJ を再起動する。
2. マクロ
Plugins>Macro>Recordsで記録. ここからエディタへコピペ
Editで編集できる。
// 元画像のIDをゲット
temp_ID = getImageID();
// 選択
selectImage(temp_ID);
// アクティブな画像のスタック数や幅を取得
frameN = nSlices;
width = getWidth;
hight = getHight;
3. メモ
PIV (particle image velocimetry)
https://sites.google.com/site/qingzongtseng/piv
3-2. 画像のブレを補正する。
StackRegというプラグインでできる。TurboRegもインストールする必要あり。
TurboReg
http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/
StackReg
http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/
画像を200x200 pixelに縮小する
Image>Scale (Ctr+E)