Jääkausiteorian vastustus pohjautuu monesti vanhentuneeseen, puutteelliseen tai väärään tietoon. Jääkausiteorian kriitikko ei esitä lukijalleen jäätikkötieteellistä ja luonnontieteellistä kokonaisuutta ja johdattelee lukijaa toissijaisilla seikoilla harhaan. Nykyajan mannerjäätiköistä tehtävät havainnot kumoavat useimmat jääkausiteoriaa vastustavat väitteet. Toiset jääkausiteorian vastaväitteet perustuvat vääriin käsityksiin tutkijoiden väitteistä, ja jotkut jääkausiteorian paradoksit on kyetty ratkaisemaan.
Ilmastoon perustuvat: Lämpötila ja kosteus
Lämpötila ei pudonnut tarpeeksi
Maan rataan ja akseliin perustuvat:
Milankovicin jaksot eivät selitä jääkausia
Akselikallistuman muutos ei selitä jääkausia
Eläimistö- ja kasvifossiileihin perustuvat:
Arotundra ei elättänyt mammutteja
Puita kasvoi mannerjään sisässä
Mammutit ja monet muut eläimet kuolivat äkisti
Jäätikkötieteeseen perustuvat:
Väärä silokallioiden uurteiden suunta
Laajoja jäättömiä alueita korkeilla leveysasteilla ja vuoristoissa
Jääkausi päättyi liian nopeasti
Geologiaan tms. perustuvat:
Jääkaudet olisivat vaatineet nopeita mannerliikuntoja
Tulivuorenpurkauksen pilvi ei selitä jääkausia
Maa painuu alas Tanskan seuduilla, ei nouse
Hiidenkirnut eivät syntyneet hitaissa vesivirroissa
Yleiset
Jääkausien syistä on esitetty monia teorioita
Jäätiköiden synty olisi ollut mahdotonta: liian korkea lämpötila, liian vähän kosteutta, Maan askselikallistuman ja radan muutokset ,suuri tulivuorenpurkaus tai mannerliikunnot eivät selitä jääkausia
Jäätiköt eivät olisi voineet sulaa: Jää ei sula Lapissa, Jää ei sula lumirajan yllä ,
Jääkausi päättyi liian nopeasti
Jäätiköt eivät synnyttäneet havaittuja muodostumia: Silokallion uurteet väärin, samoin hiidenkirnut eivät synny jääkauden takia,jää ei liiku, maa painuu alas Tanskan seuduilla
Jääkauden aikaisiksi väitetyt fossiilit eivät tue jääkausiajatusta: Arotundran liian rikas lajisto ja sen äkillinen katoaminen, eliöitä eli väitetyn mannerjään sisässä,
laajoja jäättömiä alueita korkeilla leveysasteilla ja vuoristoissa