Vi har lavet PCR og Gel-elektroforese på nogle ukendte bakterier.
I PCR blev der anvendt:
Forward primer = 341F : 5’-TACGGGAGGCAGCAG-3’
Revers primer = 907R: 5’-CCGTCAATTCCTTTGAGTTT-3’
Nu skal vi undersøge om det kan være fra:
a) Streptococcus pneumoniae
b) Bacillus anthracis
c) Legionella pneumophila
d) Staphylococcus aureus
Download sekvenserne fra de fire bakterier som en word-fil. Vær opmærksom på, om der forekommer linjeskift eller mellemrumstegn i sekvensen, da det kan gøre det umuligt at finde de rigtige sekvenser)
Find og marker primer-binding-sites. Det er kun primersites og sekvensen mellem primer-sites, som bliver opformeret ved PCR. (Brug søgefunktionen i word)
Find og marker sites, hvor restruktionsenzymet "Mbol" skærer DNA'et over. (GATC) - Skærer til venstre for G.
Find og noter længderne på restriktionsfragmenterne. (brug ordtælling)
Stemmer de oprindelige restriktionsfragmenter fra vores genteknologiske undersøgelse med nogen af bakterierne?