1. Læsning
Læs side 750-756 i Yubio A (2022). Fokus er på:
Aminosyrernes generelle struktur og rolle.
Kemiske egenskaber som syre-basereaktioner og isoelektriske punkter.
Betydningen af aminosyrer for proteinsyntesen og deres klassifikation efter ladning og polaritet.
2. Arbejdsspørgsmål
arbejd individuelt eller i par og besvarer følgende spørgsmål:
Beskriv opbygningen af en generel aminosyre og forklar, hvordan de forskellige radikaler påvirker aminosyren.
Hvad er en amfolyt, og hvordan ændrer aminosyrer ladning i forhold til pH?
Forklar begrebet "isoelektrisk punkt" og betydningen for en aminosyres ladning.
Hvordan kan aminosyrer adskilles ved hjælp af elektroforese? Giv eksempler på anvendelser af denne metode.
Strukturtegning: Tegn opbygningen af alanin ved dens isoelektriske punkt og angiv ladning.
Forklar hvad der sker med alanin, hvis man sænker eller hæver pH-værdien.
3. Case A: Adskillelse af tre aminosyrer
Du arbejder som laboratorieassistent i et forskningsprojekt, der undersøger proteinindholdet i forskellige fødevarer. Dit mål er at analysere indholdet af tre specifikke aminosyrer i en prøve: asparaginsyre, alanin og arginin. For at kunne måle koncentrationen af disse aminosyrer individuelt skal du adskille dem fra hinanden. Du vælger at bruge en elektroforesemetode til at opnå dette.
Opgave:
Beskriv, hvordan du vil planlægge og udføre forsøget med elektroforese for at adskille asparaginsyre, alanin og arginin i din prøve.
Brug din biologiske viden til at forklare, hvorfor pH-niveau er vigtigt, og hvordan du udnytter de kemiske egenskaber af aminosyrerne i forsøget.
4. Case B: Mutation i hæmoglobingenet og konsekvenser for proteinets funktion
Som genforsker har du opdaget en mutation i hæmoglobingenet, der koder for proteinet hæmoglobin, som er ansvarligt for at transportere ilt i blodet. Denne mutation har resulteret i en ændring af aminosyresammensætningen, hvor en aminosyre med en polær sidekæde er erstattet af en med en upolær sidekæde. Dette kan påvirke hæmoglobinets struktur og dets evne til at binde ilt. I denne case skal du undersøge og analysere betydningen af denne mutation for hæmoglobins funktion.
Normalt gen:
En sektion af DNA-sekvensen for hæmoglobinet lyder normalt som følger:
Original sekvens: 5'-…AAT GCT GAC TTC…-3'
En punktmutation har ændret DNA-sekvensen, hvor en enkelt base er udskiftet.
Muteret sekvens: '-…TAT GCT GAC TTC…-3'