Упорное сопротивление превосходящим силам фашистской Германии в боях за Кобрин оказали в первые дни войны летчики 123‑го истребительного авиационного полка под командованием майора Бориса Сурина и 22‑я танковая дивизия под командованием генерал‑майора Виктора Пуганова. На борьбу в оккупации поднялось население Кобринского района. Здесь действовало десять партизанских отрядов, две разведывательно‑диверсионные группы от штаба Красной Армии. 

22 июня 1941 г. на 123 истребительный полк, базировавшийся на Кобринском аэродроме, вражеские бомбы обрушились в 4 часа 30 минут. В первый день войны летчики в течение 10 часов вели непрерывные воздушные бои, сбили 30 фашистских самолетов, потеряв при этом 9 своих. В неравном бою погиб командир полка Сурин Б.Н. который провел 4 воздушных боя и лично сбил 3 вражеских самолета. Лейтенант Рябцев 22 июня около 10.00 в бою под Брестом совершил один из первых воздушных таранов в эту войну.

В ожесточенных боях на подступах к Кобрину наши бойцы и командиры проявили исключительный героизм. В полдень на расположения этих войск дважды обрушивались бомбовые удары фашистов. Разгорелся встречный танковый бой. Однако, стрелки продолжали стойко держать оборону. Особенно беззаветно сражался батальон 6-й стрелковой дивизии под командованием капитана Ольшевского. Не прекращая командования боем в районе деревни Именин погиб командир дивизии генерал-майор Пуганов В.П.

К вечеру 23 июня 1941 года гитлеровцы вступили в город. С этого момента начался самый трагический период во всей его более чем семисотлетней истории.

В Кобрине фашисты разрушили и сожгли более 200 жилых домов, свыше 250 других построек, взорвали электростанцию, 3 мельницы, кожевенный завод, лесозавод и другие предприятия, разрушили железнодорожную станцию, 2 железнодорожных моста через реку Мухавец и канал общей протяженностью 250 м.

В июле 1941 г. частями гестапо на улицах нашего города были схвачены более 200 мирных граждан. Их вывезли за город в район имения Патрики и расстреляли.

В августе 1941 г. местными оккупационными войсками под предлогом выдачи пособий в здании школы №1 были вызваны все нетрудоспособные больные жители города с семьями в количестве 180 человек. Они были расстреляны в районе деревни Именин.

Осень 1941-весна 1942 г. – широкий размах получило партизанское движение, этому способствовало и то обстоятельство, что район изобилует лесными массивами.

За время деятельности партизанских отрядов, входящих в бригаду имени Чапаева, и бригады в целом с 8 апреля 1942 г. по 25 июля 1944 г. были нанесены гитлеровским захватчикам следующие потери: взорвано железнодорожных мостов -1; спущено под откос эшелонов - 125; взорвано шоссейных мостов - 25; уничтожено линий связи - 273 км.

19 июля 1944 г. части 61 Армии подошли к Кобрину, перед ними была поставлена задача: не нанося повреждений городу, взять его с ходу, одним ударом и уже 20 июля, Кобрин был освобожден. За успешные боевые действия по освобождении города 12 полкам 61 Армии было присвоено наименование «Кобринских». 

За весь период оккупации общее число расстрелянных, замученных, сожженных заживо в городе Кобрине и районе составляет около 13 тысяч человек.

 Недалеко от Кобрина в ходе подготовки операции по освобождению Бреста, совершил свой последний подвиг Арсений Иванович Морозов. 19-летним он начал войну, с первых ее дней. Арсений Иванович прошел славный боевой путь от рядового до заместителя эскадрильи. Он был одним из лучших летчиков корпуса. Совершил 271 боевой вылет, провел 33 воздушных боя, лично сбил 13 самолетов противника. 

Тогда, 27 июля 1944г. Морозов получил задание от штаба полка разведать места сосредоточения войск противника, возможные направления отступления. Задание он выполнил. Можно было возвращаться на аэродром. Но по пути от Бреста к Кобрину у одной из переправ он заметил скопление вражеских войск и техники. По связи он запросил разрешение штурмовать вражескую колонну, хотя по характеру своего задания он мог этого не делать. И прежде, чем поступило разрешение, он круг за кругом стал заходить над колонной и уничтожать технику противника. В последний момент Морозов был смертельно ранен, самолет подбили. Теряя последние силы, Арсений Иванович дотянул самолет до освобожденной территории, посадил его, как говорят летчики, на «брюхо» - шасси не было. Когда же подоспели товарищи, Морозов был мертв. Посмертно ему присвоено звание Героя Советского Союза.            

Морозова похоронили в центре города, а сквер назвали его именем. В 1959 году останки его были перенесены в сквер им В.П. Пуганова. Там, в Братской могиле, захоронено 174 воина и партизана, погибших при освобождении города. Есть надгробия на могилах Виктора Павловича Пуганова и Арсения Ивановича Морозова, символизирующие начало и окончание войны для Кобринщины.