FreeFem++ on ubuntu on Windows [2017-01-04]

Post date: 2017/01/04 3:54:59

[ この記事は古くなりました。現在は Microsoft Store からインストールできます]

FreeFem++-mpi を ubuntu on Windowsで起動するために試してみました．何となくネットワークが不安定ですが，FreeFem++-3.50 が動きました．仮想化せずに動くので軽快です．

プログラムと機能 -> Windows の機能の有効化または無効化
1. Windows subsystem for Linux (beta) を有効化
2. 再起動
スタートメニュー : 設定 -> 更新とセキュリティ -> 開発者向け
1. 開発者モードへ (警告が出る)
2. 「一部の機能は再起動。。。」(しばらく「開発者モードのパッケージを検索」している場合は放置)
3. 念のため再起動
スタートメニュー : W -> Windowsシステムツール -> コマンドプロンプト起動
1. bash
2. ubuntu のインストールを確認されるので、"y" でダウンロード開始、ファイルシステム展開
3. User 名、Passwd 入力 (Windows と違ってOK)
SSH server の停止（開発者モードにすると SSH サーバがインストール、起動されるので、不要なら停止）
1. コントロールパネル -> システムとセキュリティ -> Windowsファイアウォール -> 許可されたアプリ
  1. 「設定の変更」でSsh Server のチェックを外す
2. 「サービス」を起動
  1. SSH Server Broker と SSH Server Proxy のプロパティを開き、停止、無効化
ubuntu 上の設定
1. "Bash on Ubuntu on Windows" を起動
2. $ hostname # ホスト名の確認
3. $ sudo vi /etc/hosts # 127.0.0.1 localhost _HOSTNAME_ を追記
4. 必要なら日本のサーバへ変更
  - $ sudo sed -i.bak -e 's%http://.*.ubuntu.com%http://ftp.jaist.ac.jp/pub/Linux%g' /etc/apt/sources.list
  - または
  - $ sudo sed -i.bak -e 's%http://.*.ubuntu.com%http://jp.archive.ubuntu.com%g' /etc/apt/sources.list
Install
1. $ sudo apt-get update
2. $ sudo apt-get upgrade
3. $ sudo apt-get install build-essential gfortran gnuplot openmpi-bin libopenmpi-dev libatlas-dev m4 bison flex freeglut3-dev
4. $ vi .bashrc
  1. export DISPLAY=localhost:0.0
Xserver 導入
- VcXsrv Windows X Server
- Xming X Server
FreeFem++ 導入
1. $ wget http://www.freefem.org/ff++/ftp/freefem++-3.50.tar.gz
2. $ cd freefem++-3.50
3. $ ./configure --enable-download
4. $ download/getall # 何回か繰り返して，全てダウンロードしたことを確認 (blas.tgz の MD5エラーは無視)
5. $ make | tee make.out
  1. download/mumps-seq/MUMPS_5.0.2/src/mumps_static_mapping.F のコンパイルで失敗したら，download/mumps-seq/Makefile-mumps-5.0.2.inc の TYPO を修正し，make clean して再度実行
6. $ sudo make install
7. $ cd example++-mpi
8. Test run : 例えば$ ff-mpirun -np 4 DDM-Schwarz-Lame-3d.edp (タスクマネージャーを起動しておくと 4 プロセス動いていることが確認できます)

注意：

ubuntu on Windows について
- サーバとしての環境ではなく、開発環境であることに注意
- bash on ubuntu がたまにハングアップすることあり
- Virus check ソフトによるネットワーク遮断あり
  - download 中のみ Virus check ソフトの「ネットワーク脅威防止」の停止が必要になる場合あり (SymantecEndpointProtection では度々遮断されていた)
  - Firewall ルールの設定で該当サーバへの通信(できたらポートも制限)を許可することで対応可能（要注意） [参考: Symantec Endpoin Protection でアプリケーション（bash.exe）に対してFW許可したい]
- ファイルは “%LocalAppData%\LxSS” 以下にある(フルパス直打ちすると Windows 側から見れる)
開発者モードにすると SSH server がインストールされ、起動されるので、できるだけ停止（Windowsアカウントでログインでき、セキュリティ的にはやや怖い）
FreeFem++-3.50
- download/getall した際に blas.tgz で MD5 エラーが起きる -> libatlas を利用 (2017-01-04現在)
- mumps-seq (MUMPS の sequential 版 library) コンパイル時に、ソース内で mpif.h 等が呼ばれていることを考慮していないためにエラー発生
  - download/mumps-seq/Makefile-mumps-5.0.2.inc の TYPO (上述)

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