AUTOdat
b.XXX, s.XXX フォーマットのファイルからのデータ切出しツール
Last update : 2021-11-28
News:
[2021-12-05] Python 版作業中：GitHub
[2021-11-28] 分岐図を表示する plotAUTOdatb.py 試作版を公開しました．( $ python3 plotAUTOdatb.py < b.xxx )
AUTOdat (python 版)
AUTOdatb, AUTOdats は分岐解析ツール AUTO の b.XXX や s.XXXX という出力ファイルから個別のデータを切り出す python プログラムです。
切り出したデータを gnuplot 等の他プログラムで読み込ませることによっていろいろなグラフを作ることができます。
AUTOdat (perl script 版)
AUTOdatb, AUTOdats は分岐解析ツール AUTO の b.XXX や s.XXXX という出力ファイルから個別のデータを切り出す perl script です。
切り出したデータを gnuplot 等の他プログラムで読み込ませることによっていろいろなグラフを作ることができます。
Ver. 0.2 [ 2008.12.04 ] AUTOdat-0.2.tar.gz
使い方
AUTOdatb, AUTOdats を $AUTO_DIR/cmds へコピーしておく。もちろん perl がインストールしてあることが条件です。
AUTOdatb
b.XXX ファイルからブランチデータとラベルデータをファイルに書き出します。
$ AUTOdatb < b.XXX
Branch-n.dat : ブランチデータ (ただし n はブランチ番号ではありません。）
LABEL-n.dat : ラベル番号 n のデータ
AUTOdats
s.XXX ファイルから解とパラメータのデータをファイルに書き出します。
すべてのラベル番号のデータを書き出す
$ AUTOdats -A < s.XXX
n.dat : ラベル番号 n の解データ
n.prm : ラベル番号 n のパラメータデータ
ラベル番号 n のデータを書き出す
$ AUTOdats n < s.XXX
データのスキャンのみ
$ AUTOdats < s.XXX
注意
各スクリプトの1行目で perl の所在を /usr/bin として書いてあります。もし違うところにある場合は書き直してください。
gnuplot を使ってグラフを表示した簡単な例
demos/pp2 での使用例 [ Graph examples for AUTOdatb, AUTOdats ]
データの準備
$ AUTOdatb < b.pp2
$ AUTOdats 13 < s.pp2
$ AUTOdats 14 < s.pp2
$ AUTOdats 15 < s.pp2
$ AUTOdats 16 < s.pp2
$ AUTOdats 17 < s.pp2
Branch
$ gnuplot
gnuplot> set xlabel "p1"
gnuplot> set ylabel "u(1)"
gnuplot> plot \
"Branch-1.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-2.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-3.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-4.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-5.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-6.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-7.dat" u 5:7 w p,\
"Branch-8.dat" u 5:7 w p
Branch-LABEL
gnuplot> plot \
"Branch-1.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-2.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-3.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-4.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-5.dat" u 5:7 w l,\
"Branch-6.dat" u 5:7 w l,\
"LABEL-1.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-2.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-3.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-4.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-5.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-6.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-7.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-8.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-9.dat" u 5:7 w p,\
"LABEL-10.dat" u 5:7 w p
Solution
gnuplot> set xlabel "x"
gnuplot> set ylabel "y"
gnuplot> plot \
'13.dat' u 2:3 w l, \
'14.dat' u 2:3 w l, \
'15.dat' u 2:3 w l, \
'16.dat' u 2:3 w l, \
'17.dat' u 2:3 w l