Post date: 2019/05/18

CentOS7 + intell compiler

本来のコンパイル方法を実施した際の問題点：

1. autoreconf が無い
   • autoconf-2.69をコンパイルし，インストール
2. automakeが古い (1.13)
   • automake-1.15 をコンパイルし，インストール
3. reconfigure で PETSc が認識できない
   • configure: find real ( real ) petsc in /usr/local/ff-petsc/real/lib/petsc/conf/petscvariables
   • configure: " Warning PETSC MPI and FF++ MPI not the same: mpiexec != /opt/intel/compilers_and_libraries_2019.2.187/linux/mpi/intel64/bin/mpirun or real != real ."
   • configure: without petsc *****
   • configure スクリプト内で，MPIRUN=mpirun と /usr/local/ff-petsc/real/lib/petsc/conf/petscvariables内の MPIEXEC=mpiexec が一致しないため
   • そのままだとMPIRUN=mpirun != mpiexec となり，PETSc を検知できていない
   • gcc +OpenMPI だと mpirun と mpiexec が同じ orterun をさしているが，intel compiler では別物(mpirun と mpiexec.hydra)
4. sudo make install で intel compiler のlibiomp5 が見つからない
   • intel compiler のライブラリpath等の設定が必要