Le Pharo est tout autant un haut-lieu de la formation en médecine tropicale, un centre de perfectionnement où, entre deux séjours outre-mer, certains viennent préparer des concours et suivre des stages de recyclage et de spécialisation. École de pensée biologique et médicale, creuset de doctrines et de méthodes originales, ses locaux ont abrité de nombreux colloques et congrès, souvent internationaux.
En 1907, dès la fin du stage d'application de la première promotion, il parut nécessaire d'envisager un parrainage à la promotion afin d'en resserrer la cohésion avant le départ tant attendu mais aussi un peu redouté. Cette pratique se perpétua, de façon irrégulière, pour 28 promotions qui se sont succédées au Pharo et ceci jusqu'en 1959. Les élèves choisissent pour nommer leur promotion des noms, fonctions des circonstances, des noms d'Anciens, illustres ou plus humbles souvent dramatiquement et glorieusement disparus. Cette pratique initie la tradition des parrainages de promotion dans le Service de santé.
1907 : La Marseillaise
1908 : L'Indochinoise
1909 : Koyama
1910 : L'Africaine
1911 : Médecin capitaine Gérald Mesny
1912 : Maroc
1927 : Médecin général inspecteur Alexandre Lasnet
1928 : Albert Calmette
1929 : Médecin major de 2°classe René-Paul Guillet
1930 : Médecin général inspecteur Albert Clarac
1931 : Maréchal Joseph Joffre
1933 : Médecin général inspecteur Jules Emily
1934 : Médecin général inspecteur Alfred Lecomte
1938 : Médecin général inspecteur Paul-Louis Simond
1940 : Médecin colonel Marie-Joseph Ferdinand Robert
1941 : Médecin colonel Eugène Jamot
1942 : Médecin aspirant Pierre-Gilbert Dubourg
1943 : Médecin colonel Alexandre Yersin
1944 : Pharmacien colonel Numa Cyrille Laffitte
1951 : Médecin général Paul Roques
1952 : Médecin lieutenant Maurice Loiseau
1953 : Médecin lieutenant-colonel Georges Coste
1954 : Médecin capitaine Roger Asquiasciati
1955 : Médecin général inspecteur Jean-Henri Raynal
1956 : Médecin capitaine Pierre-Robert Farges
1957 : Médecin commandant Jean Grima
1958 : Médecin lieutenant Roger-Lazare Casimirius
1959 : Médecin lieutenant Philippe-Robert Enault.
Cette Ecole mondialement connue a officiellement fermé ses portes le 1° juillet 2013. La cérémonie de clôture s'est déroulée le 13 juin en présence des hautes autorités locales civiles, militaires et universitaires ainsi et de l'ensemble de la Direction du Service de Santé des Armées.