Все живые существа схожи по строению и принципам обмена веществ, но также имеют много различий. Даже особи одного вида различаются по некоторым свойствам и признакам: морфологическим (цвет глаз), физиологическим (способность переваривать лактозу), биохимическим. В конце концов сходство и различие организмов определяется набором белков.
Некоторые белки, выполняющие одинаковые функции, могут иметь одинакокове строение у разных видов. Например - гормон инсулин - одинаков у собаки и у человека. Тогда как боьшинство белков, выполняющих одну и ту же функцию, несколько отличаются по строению у разных особей одного и того же вида. Такое разнообразие белков обуславливает индивидуальную специфичность организмов.
Известно, что в эритроцитах содержится белок гемоглобин, состоящий из железосоержащего пигмента гема и белка-глобина.
Все здоровые люди имеют гемоглобин с одинаковой первичной и пространственной структурой. Однако люди, страдающие серповидноклеточной анемией - тяжёлым наследственным заболеванием, имеют эритроциты похожие на серпы:
Такое изменение формы клеток происходит из-за отличия первичной структуры гемоглобина у больных людей. В бетта-глобуле вместо шестой аминокислоты - Глутаминовой (Глу), стоит аминокислота - Валин (Вал). Из 574 АК заменена только одна аминокислота в бетта глобулах, но это приводит к существенному изменению структуры белка, и как следствие, к изменению формы и нарушению функции эритроцита.
Такие эритроциты плохо переносят кислород и углекислый газ. На этом примере мы видим, что форма и функции клеток, зависят от структуры входящих в их состав белков.
Белки являются необходимыми компонентами всех клеток, поэтому наиболее важным процессом пластического обмена является биосинтез белка. Информация о структурах белка зашифрована в виде последовательности нуклеотидов молекулы ДНК. Ген - это участок ДНК, кодирующий информацию о структуре одного, конкретного, белка. Простейшую схему реализации наследственной информации можно записать в виде схемы:
Генетический код - это система записи генетической информации в клетке в виде определённой последовательности нуклеотидов в ДНК.
1. Триплетность - каждой аминокислоте соответствует комбинация из трёх нуклеотидов - триплет.
2. Избыточность (Вырожденность) - четырёхбуквенный код образует 4^3= 64 комбинации, а аминокислот только 20, следовательно одну и ту же аминокислоту может кодировать несколько триплетов (кодонов).
3. Специфичность (Однозначность) - каждый триплет (кодон) кодирует только один -определённый вид аминокислоты.
4. Неперекрываемость - генетический считывается непрерывно каждый триплет друг за другом, нельзя пропускать или перескакивать нуклеотиды.
5. Наличие стоп-кодонов - существует три триплета, которые не кодируют ни одну аминокислоту, на них биосинтез белка завершается.
6. Наличие старт-кодона - практически 90% белков начинают считываться с так называемого старт-кодона: 3'-ТАЦ-5' (ДНК) 5'-АУГ-3' (РНК), данный кодон кодирует аминокислоту метионин (Мет)
7. Универсальность - генетический код одинаково считывается у всех живых организмов, от вирусов и бактерий до растений и животных.
Вся генетическая информация о структурах белка зашифрована в геноме ДНК. ДНК огромная линейная молекула которая состоит из множества генов (около 1000) и не способна покинуть ядро. Соответственно необходим посредник, которым выступает матричная мРНК.
Биосинтез белка протекает в два этапа:
Транскрипция - это считывание генетической информации о структуре одного - конкретного белка с нуклеотидной последовательности ДНК в нуклеотидную последовательность РНК.
Или это процесс синтеза РНК на основе матрицы ДНК.
Как в любом матричном процессе, в процессе транскрипции выделяют 5 ключевых элементов:
матрица - одна из цепей ДНК (3' ← 5' );
растущая, синтезируемая цепь - РНК (5' → 3' );
Субстраты для синтеза (АТФ, ГТФ, ЦТФ и УТФ);
Источники энергии (АТФ, ГТФ, ЦТФ, УТФ);
Фермент РНК-полимераза и другие факторы транскрипции.
Ген - это участок ДНК, несущий информацию о структуре какого-либо белка. Клетки разных тканей одного организма дифференцированы, то есть различны по функциям. Так фермент амилаза, расщепляющий крахмал, образуется как клетками слюнных желёз, так и клетками поджелудочной железы. Только в эритроцитах образуется гемоглобин, и только в клетках гипофиза синтезируются белки гормона роста - соматотропина. В каждой клетке нашего тела одинаковый набор ДНК, однако среди огромного количества генов, среди них есть активные гены их называют транскриптоны и неактивные - заблокированные белком-репрессором.
Так например в мышечной клетке ген о белке-ферменте инсулине или белке гемоглобине будет неактивным, то есть заблокированным. Кроме того, клетка не производит специфичные для себя белки как конвейер, в ней имеется сложный механизм, регулирующий "включение" и "выключение"
Давайте рассмотрим строение активных генов - транскриптонов эукариот:
Так в строении гена выделяют следующие структуры:
Промотор - начало гена, это распознаваемый участок, посадочная площадка для фермента РНК-полимеразы.
Терминатор - окончание гена, участок где заканчивается процесс транскрипции.
Стадии транскрипции:
Инициация - ТАТА-бокс промотора обеспечивает присоединение РНК-полимеразы к участку ДНК. Под действием специальных белков происходит раскручивание частка спирали ДНК, при этом разрушаются водородные связи между двумя цепями, и одна из цепей (транскрибируемая) - выступает матрицей - ДНК (3' ← 5' )
Элонгация - собственно синтез РНК по принципу комплементарности (А=У, Т=А, Ц≡Г, Г≡Ц) со скоростью 40-50 нуклеотидов в секунду.
Терминация - РНК-полимераза останавливается достигая терминирующих кодонов. Фермент РНК-полимераза и синтезированная молекула РНК отделяются от ДНК, а сама ДНК восстанавливает двойную спираль
В случае транскрипции иРНК, синтезируется незрелая - предшественник, содержащий кодирующие (экзоны) и некодирующие (интроны) участки. Соответственно перед тем как иРНК покинет ядро, ей необходимо пройти созревание или процессинг.
Процессинг иРНК включает:
Кэпирование 5' конца;
Полиаденилирование 3' конца;
Сплайсинг - удаление интронов - участков некодирующих белок, и связывание экзонов. Осуществляется с помощью комплекса белков - сплайсосомы.
Зрелая иРНК покидает ядро через ядерные поры и выходит в цитоплазму для осуществления процесса трансляции.
Трансляция - это процесс перевода нуклеотидной последовательности иРНК в аминокислотную последовательность белка.
Трансляция протекает на рибосомах, и как любой матричный процесс включает в себя 5 ключевых элементов:
матрица - иРНК (5' → 3' );
растущая, синтезируемая цепь - Полипептид
Субстраты для синтеза - 20 протеиногенных аминокислот;
Источники энергии - ГТФ;
Рибосомальные белки и рРНК, белковые факторы.
Стадии трансляции:
Инициация - сначала к мРНК присоединяется малая субъединица рибосомы (40S), затем присоединяется первая транспортная РНК (метионил-тРНК) вместе с ГТФ, после всего присоединяется и большая субъединица рибосомы (60S).
Элонгация - в большой субъединице имеется три сайта:
А-сайт - аминоацильный - сюда будут поступать новые и новые тРНК, связываясь с иРНК по принципу кодон-антикодон;
P-сайт - пептидильный - здесь происходит образование пептидной связи между аминокислотами. При этом происходит переброс группы аминокислот к новой - последующей аминокислоте, при этом разгружается предыдущая тРНК;
E - сайт - элиминационный - разгруженная тРНК, оказываясь в этом сайте, покидает рибосому.
Терминация - трансляция продолжается до тех пор, пока А сайт не достигнет СТОП-кодона, в этот момент в А-сайт вместо тРНК поступает рилизинг фактор. Синтезированный полипептид высвобождается, а весь комплекс распадается.
Образованный полипептид, как правило затем подвергается посттрансляционной модификации в цистернах эндоплазматической сети и полостях Гольджи, где незрелые белки дозревают до функционально зрелых - гормонов, секретов, ферментов или белков мембран.
Процесс биосинтез белка на одной иРНК, как правило, многократен и протекает с образованием полирибосом (полисом), так как одна иРНК соединяется с несколькими рибосомами. Весь процесс синтеза одного белка занимает 20 - 500 с.