La gran pregunta que se ha hecho la humanidad desde tiempos inmemoriales es esta: "¿Estamos solos en el Universo?" Pues la respuesta a esa pregunta llego en el año 2148, cuando unas ruinas encontradas en Marte le dijo a la humanidad que, al menos en el pasado, no estuvo sola. Ademas de la respuesta a esa pregunta, esas ruinas le dieron a la humanidad la tecnologia necesaria para viajar a las estrellas. El ansiado primer contacto llego en 2157, revelando que la humanidad solo era la recien llegada al vecindario galactico, ya que habian otras especies que habian hecho lo mismo que los humanos siglos o incluso milenios antes.

En el año 2183, y no sin algun que otro roce, la humanidad se ha hecho un hueco en la comunidad galactica. Pero el hallazgo de una baliza comienza a arrojar sombras sobre ese futuro idilico. Esa sombra es la de los segadores, una especie de maquinas inteligentes aparentemente responsable de la extincion de civilizaciones enteras en ciclos de 50.000 años. Se acerca el momento de la purga, y humanos, turianos, salarianos, asari, krogan y otras muchas especies estan en su punto de mira. Y la unica que puede impedirlo es la comandante Yang Shepard, a quien acompañaremos en esta trilogia.