Tras 19 años en el Refugio, y poco después de que lo haga su padre, Alix se ve obligada a abandonar el Refugio 101. Ahora, sin mas remedio que adentrarse en las ruinas de lo que en su día fue Washington D.C., ahora Yermo Capital, tiene la tarea de averiguar donde esta su padre. Eso le llevara a descubrir que, antes de que ella naciera, su padre estuvo involucrado en un proyecto que, de salir bien, proporcionaría agua limpia a toda la zona de Yermo Capital. Eso, lógicamente, convertiría a aquel que lograra controlarlo en la facción hegemonica de la región. Y dos facciones están interesadas en el Proyecto Pureza, la Hermandad del Acero, la orden de caballería tecno-religiosa heredera del Ejercito de los Estados Unidos, y el Enclave, la siniestra organización militar y fascista sucesora del Gobierno de los Estados Unidos y antaño su gobierno en la sombra.