Embase tiene una taxonomía propia (Emtree) que permite una recuperación de bibliografía con unas características diferentes a Pubmed. Sus reglas de funcionamiento y los filtros lo convierten en un gran recurso bibliográfico que puede facilitar la búsqueda rápida y la suscripción vía RSS a las búsquedas. En la página http://www.embase.com/info/helpfiles/search-hints hay muchas ayudas para aprender a utilizarlo.