Coloquio del 13/09/2012

Secuenciamiento del genoma de la papa y análisis del transcriptoma

de papas nativas bajo estrés hídrico usando RNAseq

Gisella Orjeda y Roberto Lozano

Universidad Peruana Cayetano Heredia

Lugar:

Aula E202 de Estudios Generales Ciencias

(Av. Universitaria cdra. 18, San Miguel, Lima)

Fecha y hora:

Jueves 13/09/2012, 12:30 p.m.

La papa es el cuarto cultivo más importante del mundo. Genéticamente, la papa es una especie bastante difícil de mejorar de modo tradicional debido a su genética y biología sexual. El Consorcio del Genoma de la Papa (PGSC) publicó la secuencia y anotación del genoma y desarrolló técnicas efectivas de cartografía genética, y análisis de su transcriptoma, proteoma y metaboloma [Nature 2011, vol. 475]. Todos estos resultados proveen una plataforma de inigualable potencial para el mejoramiento genético de este cultivo, pero debemos generar las competencias bioinformáticas y de mejoramiento asistido por biología molecular para aprovechar este conocimiento, más aún en el marco del cambio climático. En esta presentación hablaremos sobre el secuenciamiento del genoma de la papa en el que participó la Unidad de Genómica (GRU) de UPCH. GRU ha seguido trabajando con la información de la secuencia del genoma de la papa y ha identificado los genes de resistencia presentes en el genoma [PLoS ONE 7, 4] y los genes de calidad en las papas nativas peruanas y está trabajando para identificar los genes implicados en la respuesta a estrés hídrico utilizando tecnologías de secuenciamiento de última generación. Presentaremos los primeros resultados del análisis del transcriptoma de papas nativas bajo estrés hídrico usando la nueva y revolucionaria técnica de secuenciamiento conocida como RNAseq. (Click aquí para ver el afiche.)

Ingreso libre. Habrá café y galletas.

Informes: coloquios@fisica.pucp.edu.pe