00 bibL

Эпи- генетическая эволюция, qeg001 etc. egeYxxx - плохо (ЕГЭ для России).

Количественная эпигенетика с подачи Эрика Ричардса "Quantitative epigenetics" позволяет ввести сокращение qeg = Start from qegYxxx, Y=200Y

Литература

\bibitem{qeg901} Eva Jablonka and Gal Raz. Transgenerational Epigenetic Inheritance: Prevalence, Mechanisms, and Implications for the Study of Heredity and Evolution. The Quarterly Review of Biology, 2009; 84 (2): 131 DOI: 10.1086/598822

THIS \cite{qeg802} ARTICLE HAS BEEN CITED BY OTHER ARTICLES:

\bibitem{qeg902} V. V. Vagin, J. Wohlschlegel, J. Qu, Z. Jonsson, X. Huang, S. Chuma, A. Girard, R. Sachidanandam, G. J. Hannon, and A. A. Aravin. Proteomic analysis of murine Piwi proteins reveals a role for arginine methylation in specifying interaction with Tudor family members // Genes & Dev. 23, 1749-1762 (2009). http://genesdev.cshlp.org/content/23/15/1749.full free

\bibitem{qeg903} E. J. Richards. Quantitative epigenetics: DNA sequence variation need not apply // Genes Dev. 23, 1601-1605 (2009).

\bibitem{qeg904} Jon Reinders, Brande B.H. Wulff, Marie Mirouze, Arturo Mari-Ordonez, Melanie Dapp, Wilfried Rozhon3 Etienne Bucher, Gregory Theiler, and Jerzy Paszkowski. Compromised stability of DNA methylation and transposon immobilization in mosaic Arabidopsis epigenomes // Genes Dev. 23: 939-950 (2009).

\bibitem{qeg905} Frank Johannes, Emmanuelle Porcher, Felipe K. Teixeira, Vera Saliba-Colombani, Matthieu Simon, Nicolas Agier1, Agnes Bulski, Juliette Albuisson, Fabiana Heredia, Pascal Audigier, David Bouchez, Christine Dillmann, Philippe Guerche, Frederic Hospita, Vincent Colot. Assessing the Impact of Transgenerational Epigenetic Variation on Complex Traits // PLoS Genet 5: e1000530. doi: 10.1371/journal.pgen.1000530.

\bibitem{qeg906} Zhibin Wanga, Dustin E Schonesa and Keji Zhao. Characterization of human epigenomes // Current Opinion in Genetics & Development, Volume 19, Issue 2, April 2009, Pages 127-134. doi:10.1016/j.gde.2009.02.001 to take at SciDir

\bibitem{qeg907} R.N. Tchuraev, A.V. Galimzyanov. Gene and epigene networks: Two levels in organizing the hereditary system // Journal of Theoretical Biology, Volume 259, Issue 4, 21 August 2009, Pages 659-669.

Цитируют статью \cite{qeg802}

\bibitem{qeg908} A. J. Pratt and I. J. MacRae (2009) The RNA-induced Silencing Complex: A Versatile Gene-silencing Machine. // J. Biol. Chem. 284, 17897-17901

\bibitem{qeg909} R. Ishikawa and T. Kinoshita (2009). Epigenetic Programming: The Challenge to Species Hybridization. // Mol Plant 2, 589-599

\bibitem{qeg910} S. Chang, S. Wen, D. Chen, and P. Jin (2009). Small regulatory RNAs in neurodevelopmental disorders. // Hum. Mol. Genet. 18, R18-R26

\bibitem{qeg911} A.A. Aravin and G.J. Hannon (2009). Small RNA Silencing Pathways in Germ and Stem Cells. // Cold Spring Harb Symp Quant Biol

\bibitem{qeg912} Nobelprize.org search ”Epigenetics”

\bibitem{qeg913} Peanuts. Epigenetics Special Edition Newsletter. Vol. 9 Issue 1 (2009).

Zymo Research has just released its new

Epigenetics Special Edition Newsletter

  • 48-page compilation of reviews covering almost every topic in epigenetics
  • Content authored by big names like Alex Meissner, Jean Pierre Issa, and Jaroslav Jelinek
  • Insightful technology reviews on everything from MeDIP to small RNA purification

Please CLICK HERE to receive your free Epigenetics Special Edition Newsletter

In this issue:

• Reviews in Epigenetics

• Perfecting Bisulfite Treatment for DNA Methylation Analysis

• Featured Technologies

• Additional Tools for Epigenetics Research

• Tips & FAQs for DNA Methylation Analysis

Epigenetics Glossary

• Epigenetics Product Index

REVIEWS // Peanuts. Epigenetics Special Edition Newsletter. Vol. 9 Issue 1 (2009).

\bibitem{qeg914} Jason Gioia, Zymo Research Corporation. Epigenetics // Peanuts, Vol. 9 Issue 1, 5-9 (2009).

\bibitem{qeg915} Alexander Meissner, Broad Institute of MIT & Harvard. Epigenetic Regulation in Mammalian Genomes // Peanuts, Vol. 9 Issue 1, 9-12 (2009).

\bibitem{qeg916} Jaroslav Jelinek & Jean Pierre Issa, Dept. of Leukemia, University of Texas M. D. Anderson Cancer Center. Epigenetics & Cancer // Peanuts, Vol. 9 Issue 1, 12-17 (2009).

\bibitem{qeg917} Xi Yu Jia, Zymo Research Corporation. Epigenetic Regulation of Gene Expression in Insects & Plants // Peanuts, Vol. 9 Issue 1, 17-19 (2009).

\bibitem{qeg918} Epigenetics. Any gene-regulating activity that doesn't involve changes to the DNA code and that can persist through one or more generations. Презентация Liu

[PDF] Epigenetics - [ Перевести эту страницу ]

Формат файла: PDF/Adobe Acrobat - В виде HTML

HISTONE CODE – an epigenetic extension of DNA coding potential ... alters chromatin structure and assembly of different epigenetic states ...

www.life.umd.edu/classroom/BSCI411/Liu/epigenetic.pdf -

\bibitem{qeg919}

\bibitem{qeg801} Kloc A, Zaratiegui M, Nora E, Martienssen R. RNA interference guides histone modification during the S phase of chromosomal replication // Curr Biol. 2008 Apr 8;18(7):490-5.

\bibitem{qeg802} Julius Brennecke, Colin D. Malone, Alexei A. Aravin, Ravi Sachidanandam, Alexander Stark, Gregory J. Hannon. An Epigenetic Role for Maternally Inherited piRNAs in Transposon Silencing // Science, Vol. 322. no. 5906, pp. 1387 - 1392 (28 November 2008). DOI: 10.1126/science.1165171

\bibitem{qeg803} Олег Сеньков. ГЕНЫ, КОТОРЫЕ МЫ МЕНЯЕМ // В МИРЕ НАУКИ, # 11 (2008). http://www.sciam.ru/article/3965/ По результатам новейших исследований, наши гены не статичны. Геном человека - открытая система, чутко реагирующая на особенности рациона, образа жизни, а также на внешние факторы, например на состояние окружающей среды.

\bibitem{qeg701} Mark B. Gerstein, Can Bruce, Joel S. Rozowsky, Deyou Zheng, Jiang Du, Jan O. Korbel, Olof Emanuelsson, Zhengdong D. Zhang, Sherman Weissman and Michael Snyder, What is a gene, post-ENCODE? History and updated definition // Genome Res. 2007 17: 669-681.

\bibitem{qeg702} Савинов А.Б. ПРОБЛЕМА НОВОЙ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ПАРАДИГМЫ (ФИЛОСОФСКИЙ, СИСТЕМНЫЙ И ОБЩЕБИОЛОГИЧЕСКИЙ АСПЕКТЫ) // ХХI Любищевские чтения. Современные проблемы эволюции. Ульяновск: Ульяновск. гос. пед. ун-т, 2007. С. 60-72.

\bibitem{qeg703} Лопатина Т. Эпигенетический маркёр "стволовости" определяет развитие раннего эмбриона // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия, Том II, No 2, 8-9 (2007). http://www.celltranspl.ru/news/news1026 на основе статьи

Maria-Elena Torres-Padilla, David-Emlyn Parfitt, Tony Kouzarides & Magdalena Zernicka-Goetz. Histone arginine methylation regulates pluripotency in the early mouse embryo // Nature 445, 214-218 (11 January 2007) | doi:10.1038/nature05458;

N&V Helen Dell. Developmental biology: Marked from the start // Nature 445, 157 (11 January 2007) | doi:10.1038/445157a;

\bibitem{qeg600} Генетика 2006, № 9 "подборка статей в тематическом выпуске журнала «Генетика» (2006, № 9), целиком посвященна выяснению предмета, целей, задач эпигенетики и обсуждению результатов эпигенетических исследований, выполненных за последние годы мировым научным сообществом."

\bibitem{qeg601} - \bibitem{qeg612} на стр \cite{qeg600} - статьи из Генетика 2006, № 9 взять в СФУ все

\bibitem{qeg613} В.В. Хлебович, Новое окно в эпигенетику // Природа, № 7, 2006.

\bibitem{qeg614} Brona McVittie. Epigenetics // Science in School, pp.62-64, Issue 2 : Summer 2006. We tend to think of our genetic information as being encoded in DNA - in our genes. Brona McVittie from Epigenome NoE, UK, describes why this is only part of the story.

\bibitem{qeg615}

\bibitem{qeg501} Colvis CM, Pollock JD, Goodman RH, Impey S, Dunn J, Mandel G, Champagne FA, Mayford M, Korzus E, Kumar A, Renthal W, Theobald DE, Nestler EJ. Epigenetic mechanisms and gene networks in the nervous system // J Neurosci. 2005 Nov 9;25(45):10379-89.

\bibitem{qeg502} Р. И. Чураев. Контуры неканонической теории наследственности: от генов к эпигенам // Журнал общей биологии, Том 66, 2005. № 2, Март-Апрель, Стр. 99-122.

\bibitem{qeg503} Р.Н. Чураев. ГЕННЫЕ И ЭПИГЕННЫЕ СЕТИ: ДВА УРОВНЯ ОРГАНИЗАЦИИ НАСЛЕДСТВЕННОЙ СИСТЕМЫ // Вестник ВОГиС, 2005, Том 9, № 2, 199-208.

\bibitem{qeg101} Vardhman K. RAKYAN, Jost PREIS, Hugh D. MORGAN and Emma WHITELAW, The marks, mechanisms and memory of epigenetic states in mammals, Biochem. J. (2001) 356, 1-10

\bibitem{qeg102} Чураев Р.Н. Кибернетический подход как ключ к пониманию жизненных процессов // Конференция, посвященная 90-летию со дня рождения Алексея Андреевича Ляпунова. Россия, Новосибирск, Академгородок, 8 - 11 октября 2001 года.

Epigenomes and a new branch of science \bibitem{qeg001} qeg001

Эпигеномы и новая ветвь науки qeg001 rus

\bibitem{qeg002} Чураев Р.Н. О хранении, кодировании, передаче и переработке наследственной информации в живых системах // Вычислительные технологии. 2000. Т. 5. Специальный выпуск, посвященный вопросам развития геоинформационных технологий и дистанционного зондирования в СО РАН. С. 100-111

\bibitem{qeg003} Голубовский М. Д. Век генетики: эволюция идей и понятий. - СПб.: Борей Арт, 2000. - с. 262. книга есть, 4.6.2. Концепция эпигена: понятийная и логическая схема

\bibitem{qeg004} Голубовский М.Д., Чураев Р.Н. ДИНАМИЧЕСКАЯ НАСЛЕДСТВЕННОСТЬ И ЭПИГЕНЫ // ПРИРОДА, #4(980)АПРЕЛЬ 1997, 16-25 Эпигены как наследственные единицы существуют дополнительно к генам, а не вопреки им. Циклические генные системы приобретают совершенно новые особенности наследования и изменчивости.

\bibitem{qeg005} Чураев Р.Н. Гипотеза об эпигене // Исследования по математической генетике. Новосибирск: ИЦиГ СО АН СССР, 1975. С. 77-94.

\bibitem{qeg006} А.В. Прохорчук, А.С. Рузов. Метилирование генома и его роль в функционировании эукариотического организма // Генетика, Том 36, No 11, 1475-1486 (2000).