Va anar canviant al llarg dels segles, tant en la seva forma com en la seva funció. En estar situada a prop del port de la ciutat, va ser una zona molt lligada a l’activitat portuària.

Els contenidors funeraris més habituals que es van trobar dins d’aquest espai sepulcral van ser les àmfores i les teules, però també sarcòfags de pedra i plom i taüts de fusta.

Va ser descoberta el 1923 quan es van iniciar els treballs per a la construcció de la Tabacalera, la fàbrica de Tabacs. El recinte de la Necròpolis està format per una zona excavada  a l’aire lliure, l’edifici del museu, unes criptes funeràries i una zona de jardins amb sarcòfags exposats. S’han anat fent diverses actuacions a la instal·lació: el 1971, el 1986 i el 1993, entre d’altres.