На базе 3-го отряда 13 ОКИАЭ стала формироваться   Штурмовая эскадрилья ВВС КБФ, которая в последствии вошла в состав 57-го бомбардировочного авиаполка. На должность командира этой эскадрильи был назначен Кузьма Николаевич Барабанов.

В середине августа в подчинение АЭ были переданы 6 И-15бис, которые сразу включились в штурмовку позиций противника.

И-15бис младшего лейтенанта Горюнова был подбит попаданием снаряда зенитной артиллерии в мотор.13 ОИКАЭ КБФ берет начало в 1936 году. Вначале она называлась в/ч №2, затем её переименовали в 38 авиаэскадрилью, которая базировалась на аэродроме Купля. В 1937 году за короткий срок командир эскадрильи И.Г.Романенко переучил летный и технический состав с истребителя И-5 на истребители И-15 и И-16. В день Красной Армии 23 февраля 1938 года был награжден Орденом Красной Звезды. Весной 1938 году из 38 АЭ и 37 АЭ (аэродром Липово) был сформирован 42 истребительный полк., который просуществовал только одно лето, а затем 38 АЭ стала снова отдельной. В эскадрилье было три отряда, а в каждом отряде 12-14 самолетов. Первый и второй были вооружены самолетами И-16, а третий - И-15.

В сентябре 1939 года 38АЭ была переименована в в отдельную истребительную авиаэскадрилью (13 ОИАЭ). С началом Финской войны (30 ноября 1939 г. - 13 марта 1940 г.) эскадрилья с аэродрома Купля вступила в бой.За время Финской компании было совершено 1650 боевых вылета, сбито 4 самолета, уничтожено 15 зенитных пулемёта, потоплен военный корабль.

За боевые действия 27 летчиков были награждены Орденом Красного Знамени, летчики С.Е.Войтенко и И.П. Лукьянов были награждены Орденом Ленина. Командир АЭ Г.Б. Губанов и комиссар И.И.Волосевич были удостоены высокого звания Герой Советского Союза, 4 техника награждены Орденом Красной Звезды, 9 человек - медалью за боевые заслуги.

Техник Мытов Ф.Ф. был награжден Орденом Знак Почёта. Эскадрилья награждена Орденом Красного Знамени.В финской компании эскадрилья не потеряла ни одного летчика.

21 апреля 1940 года эскадрилья награждена орденом «Боевого Красного Знамени».

Командиру АЭ Губанову и Комиссару Волосевичу присвоено звание Герой Советского Союза. Летчик Лукьянов награжден орденом «Ленина». Орден «Красного Знамени» получили летчики: Сизов, Чурбанов, Князев, Алехин, Погуляйко, Чабукиани, Николаенко, Новиков.

22 июня 1941 года 13 ОИКАЭ вступила в военные действия с аэродрома Купля.  13 ОИКАЭ была поднята по тревоге с задачей прикрытия аэродрома Красная Горка и моста через реку Нарва, охранять железную дорогу Ленинград-Таллин в районе Кингисеппа. Первый самолет в Великой Отечественной войне сбил И.П.Лукьянов - комиссар эскадрильи.

К 30 июня 1941 года эскадрилья имела 22 экипажа на самолетах И-16.

С 1 июля 1941 года новое задание – прикрывать мосты через реку Нарва. С 4 июля по 5 августа АЭ выполняла эту боевую задачу. Днем дежурили четыре звена из 12 И-16, командиры – старший лейтенант Сизов и лейтенант Алехин. Ночью – два звена первого отряда старшего лейтенанта Монахова, и звено Управления АЭ, всего 9 И-16.

За этот период летчики совершили 948 боевых вылетов, отразили 21 налет на мосты. При этом сбито: 6 Ю-88, 1 Хе-111, 1 Ме-109. Наши потери – младшие лейтенанты Панченко, Беликов и старшина Безмельницев.

14 июля 1941 года противник прорвался к озеру Самро, и выдвинулся к станции Веймарн. В это время на станции Веймарн шла выгрузка войск и техники. От села Ивановское на север позиции занимали красноармейцы. От деревни Муравейно на север – немцы. У деревни Загорье – скопление войск противника.

На фронте Ивановское – Сабск – Хилок 13 КОАЭ получила приказ задержать продвижение противника, не допустив его к переправам на северный берег реки Луга, одновременно продолжая прикрытие мостов через реку Нарва.

Для выполнения приказа по задержке войск противника эскадрилья выделила 6 самолетов И-16 29 серии. Потери при штурмовке мехколонн составили: 7 самолетов, 1 летчик погиб, два получили тяжелые ранения.

15 июля 1941 года  эскадрилья совершила первый боевой  вылет.

За период с 19 июля по 27 августа 1941 года эскадрилья прикрывала самолеты ДБ-3 и СБ, производившие удары по противнику в районе озеро Самро – Муравейно – Сабск.

После ухода 12 ОКАЭ на остров Эзель борьба с авиацией противника в направлении Нарва, Котлы, Копорье легла на 13 ОКАЭ. Одновременно АЭ выполняла задачу по прикрытию транспортов из Таллина в Кронштадт.

Летчик посадил самолет на шоссе Кингисепп - Веймарн.

5 августа 1941 года мосты через Нарву были взорваны.

3-й отряд 13 АЭ, летавший до войны на самолетах И-15бис, 3 июля был направлен в Воронеж, где изучил самолет Ил-2. К 11 июля на аэродром Купля прибыли 7 Ил-2. отряд сформирован в штурмовую эскадрилью ВВС КБФ (командир АЭ – капитан Барабанов, заместитель командира – капитан Карасев).