Rのメモ

Last modified: April 29, 2014

R に関して初心者の私が大変お世話になっているページ

どうもありがとうございます。

外部パッケージインストール

ネットワークに接続していることが条件（下記は openair というパッケージをインストールする場合の例）。

install.packages('openair')
- 参考URL：http://www.openair-project.org/GettingStarted/Default.aspx
- サーバを選ぶ画面で止まってしまう (port 80 が・・・等) 場合は、
- .Rprofile に Proxy 設定と CRAN サーバの設定を施して再実行すると上手くいった。
- それでも上手く行かない場合、環境変数の http_proxy, ftp_proxy が適切に設定されているかをチェックする。
- 外部パッケージはいろいろあるようです。
- 参考URL1：http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/08.html
- 参考URL2：http://www.okada.jp.org/RWiki/index.php?CRAN%A5%D1%A5%C3%A5%B1%A1%BC%A5%B8%A5%EA%A5%B9%A5%C8

R で NetCDF を解析する

まずは以下のライブラリをインストール。

NetCDF 形式のファイルを読むための初歩

library(ncdf)
- ncdf ライブラリを呼び出す
inputnc <- open.ncdf("hoge.nc")
- inputnc という変数で NetCDF を開く
print(inputnc)
- データの大きさを確認
inputnc$var
- 座標値や変数名を確認
x <- get.var.ncdf(dat, "wmax")
- wmax という変数を NetCDF ファイルから読み出す（wmax は時刻のみの 1 次元配列を仮定）
plot(x, type="l", main="Time series of W max", xlab="Time [min]", ylab="W max [m/s]")
- まず、type="l" で線グラフを描く。
- タイトルは main 変数で決定。
- xlab, ylab は横軸、縦軸をそれぞれ示す。

proxy の設定方法

.Rprofile に以下の情報を追記する（無ければ作成しましょう）。

Sys.setenv(http_proxy="http://proxy.hoge.huga:9999/")
- 参考URL1：http://www7b.biglobe.ne.jp/~homunculus/r/rproxy.html
- 参考URL2：http://www.okada.jp.org/RWiki/?CRAN%B9%F1%C6%E2%A5%DF%A5%E9%A1%BC%A4%CE%BB%C8%A4%A4%CA%FD

CRAN サーバの設定方法

.Rprofile に以下の情報を追記する（無ければ作成しましょう）。

options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp")
- 参考URL：http://www.okada.jp.org/RWiki/?CRAN%B9%F1%C6%E2%A5%DF%A5%E9%A1%BC%A4%CE%BB%C8%A4%A4%CA%FD

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