Rのメモ

Last modified: April 29, 2014

R に関して初心者の私が大変お世話になっているページ

どうもありがとうございます。

• http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html

• http://takenaka-akio.org/doc/r_auto/index.html

外部パッケージインストール

ネットワークに接続していることが条件（下記は openair というパッケージをインストールする場合の例）。

• install.packages('openair')

  • 参考URL：http://www.openair-project.org/GettingStarted/Default.aspx

  • サーバを選ぶ画面で止まってしまう (port 80 が・・・等) 場合は、

  • .Rprofile に Proxy 設定と CRAN サーバの設定を施して再実行すると上手くいった。

  • それでも上手く行かない場合、環境変数の http_proxy, ftp_proxy が適切に設定されているかをチェックする。

  • 外部パッケージはいろいろあるようです。

  • 参考URL1：http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/08.html

  • 参考URL2：http://www.okada.jp.org/RWiki/index.php?CRAN%A5%D1%A5%C3%A5%B1%A1%BC%A5%B8%A5%EA%A5%B9%A5%C8

R で NetCDF を解析する

まずは以下のライブラリをインストール。

• install.packages('ncdf')

  • 参考URL：http://seib-dgvm.com/tips.html

NetCDF 形式のファイルを読むための初歩

• library(ncdf)

  • ncdf ライブラリを呼び出す

• inputnc <- open.ncdf("hoge.nc")

  • inputnc という変数で NetCDF を開く

• print(inputnc)

  • データの大きさを確認

• inputnc$var

  • 座標値や変数名を確認

• x <- get.var.ncdf(dat, "wmax")

  • wmax という変数を NetCDF ファイルから読み出す（wmax は 時刻のみの 1 次元配列を仮定）

• plot(x, type="l", main="Time series of W max", xlab="Time [min]", ylab="W max [m/s]")

  • まず、type="l" で線グラフを描く。

  • タイトルは main 変数で決定。

  • xlab, ylab は横軸、縦軸をそれぞれ示す。

proxy の設定方法

.Rprofile に以下の情報を追記する（無ければ作成しましょう）。

• Sys.setenv(http_proxy="http://proxy.hoge.huga:9999/")

  • 参考URL1：http://www7b.biglobe.ne.jp/~homunculus/r/rproxy.html

  • 参考URL2：http://www.okada.jp.org/RWiki/?CRAN%B9%F1%C6%E2%A5%DF%A5%E9%A1%BC%A4%CE%BB%C8%A4%A4%CA%FD

CRAN サーバの設定方法

.Rprofile に以下の情報を追記する（無ければ作成しましょう）。

• options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp")

  • 参考URL：http://www.okada.jp.org/RWiki/?CRAN%B9%F1%C6%E2%A5%DF%A5%E9%A1%BC%A4%CE%BB%C8%A4%A4%CA%FD

R のための検索エンジン

• http://seekr.jp/index.php