ДНК вида

О ВИДОСПЕЦИФИЧНОСТИ ДНК: 50 ЛЕТ СПУСТЯ (ОБЗОР)

В.С. Шнеер

Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, Санкт-Петербург, ул. проф. Попова 2, shneyer@ VS11044.spb.edu

видоспецифичность ДНК, идентификация видов, ДНК-штрихкодирование, прокариоты, эукариоты, DNA species-specificity, Species identification, DNA bar-coding, procaryotes, Eucaryotes

Рассмотрены современные подходы к идентификации видов, основанные на сравнении их ДНК. Кроме давно используемых методов идентификации видов прокариотов (нуклеотидный состав, анализ нуклеотид-ной последовательности 16S рРНК, ДНК-ДНК гибридизация) применен метод мультилокусного анализа последовательностей (MLSA), основанный на сравнении нуклеотидных последовательностей фрагментов нескольких генов. Для идентификации видов эукариотов предложено использование одного-двух стандарт-ных коротких участков генома (ДНК-штрихкодов). Обсуждаются потенциальные возможности новых под-ходов и некоторые трудности, связанные с их реализацией.

Modern approaches in DNA-based species identification are reviewed. Long used methods of species identification in procaryotes (G + С ratio, 16S rRNA nucleotide sequence, DNA-DNA hybridization) have recently been supple-mented by MLSA using difference in sequences of fragments of several genes. Sequences of one or two short DNA fragments - DNA barcodes - were suggested for all species identification in eucaryotes. Potential benefits of new approaches and some difficulties they meet are discussed.