Распознавание
http://elibrary.ru/item.asp?id=11644144
Ф. Ф. Дедус, Л.И. Куликова, С. А. Махортых, Н.Н. Назипова, А.Н. Панкратов, Р. К. Тетуев. Распознавание структурно-функциональной организации генетических последовательностей // Вестник Московского университета. Серия 15: Вычислительная математика и кибернетика. No 2, 12-16 (2007).
Название
публикации
Авторы
Журнал
Издательство
РАСПОЗНАВАНИЕ СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
Ф. Ф. Дедус, Л.И. Куликова, С. А. Махортых, Н.Н. Назипова, А.Н. Панкратов, Р. К. Тетуев
кафедра математических методов прогнозирования факультета ВМиК, radja@impb.ru
Приводятся постановки задач анализа генетических последовательностей с точки зрения современных математических и информационных подходов. Рассматриваются статистические, корреляционные, энтропийные, спектральные подходы. Дается краткое введение в историю вопроса. Прослеживается генезис нового междисциплинарного направления - биоинформатики, науки о применении компьютерных методов в биологических исследованиях. Предлагаются новые подходы в изучении макромолекулярных систем, основанные на комбинированных спектрально-аналитических технологиях. Приводятся оценки алгоритмической сложности при реализации предлагаемых подходов. Ил. 1. Библиогр. 12.
Аннотация
Список
литературы
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
Watson J.D., Crick F.H.C. Molecular structure of deoxypentose nucleic acids//Nature.1953. 171. P. 737.
Александров А. А. и др. Компьютерный анализ генетических текстов. М.: Наука, 1990.
Колмогоров А.Н. Теория информации и теория алгоритмов. М.: Наука, 1987.
Шеннон К. Работы по теории информации и кибернетике. М.: Иностранная литература, 1963.
Lemре 1 A., Z i v J. On the complexity of finite sequences//IEEE Transactions on Information Theory. 1976. V.IT-22. Issue 1. P. 75-81.
Горбань А.Н., Миркес Е.М., Попова Т.Г., Садовский М.Г. Новый подход к изучению статистических свойств генетических последовательностей//Биофизика. 1993. 38. Вып. 5. С. 762-767.
Korotkov E.V., Korotkova M.A. Latent periodicity of DNA sequences from some human gene regions//DNA Seq. 1995. 5. P. 353-358.
Benson G. Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences//Nucl. Acids Res.1999. 27. Issue 2. P. 573-580.
Noe L., KucherovG. Improved hit criteria for DNA local alignment//BMC Bioinformatics.2004. 5. P. 149 (http://www.biomedcentral.eom/1471-2105/5/149).
Moore G.E. Cramming more components onto integrated circuits//Electronics Magazine. 1965. 38. N 8. P. 114-117.
11.
12.
Гасфилд Д. Строки, деревья и последовательности в алгоритмах. СПб.: Невский проспект, 2003.
Дедус Ф.Ф.,Махортых С.А.,Устинин М.Н., Дедус А.Ф. Обобщенный спектрально-аналитический метод обработки информационных массивов. М.: Машиностроение, 1999.