下游的河口淡鹹水交會處，因受到潮汐影響，鹽度變化大，河流從上游將礦物質、有機物質及汙染物帶至河口，環境中養分高，可供應大量生物生存所需，但相對來說也較容易受到汙染。

台灣的河口：

1. 西部河口寬廣、感潮河段長、水流量較大但流速

緩、多泥灘、多紅樹林、高污染。

2. 東部河口短窄、感潮河段短、水流量較小但流速

大、礫石灘為主、冬季多無河口、部份污染。
常見的河口生物，例如彈塗魚、水筆仔、招潮蟹、文蛤等。