環境: Fedora17
# yum install audacity pavucontrol
pavucontrolはPulseAudio Volume Controlというやつです。
AudacityのInput device(真ん中辺りのマイクマークのとこ)をpulseにします。
そしたらさらに右上のLRて書いてあるとこのマイクのとこ押してStart Monitoring選びます。
次にPulseAudio Volume ControlのRecordingタブでMonitor of Internal Audio Analog Stereoとかを選びます。
あとは録音したいものを再生してAudacityの録音マーク押せば録音できます。
参考
Tutorial - Recording Computer Playback on Linux - Audacity Manual
http://manual.audacityteam.org/man/Tutorial_-_Recording_Computer_Playback_on_Linux