メタボロミクスの発展を目指して

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メタボロミクスソフトウェア講習会のご案内(開催日2018-11-12)

Human exposome(人が生涯暴露される低分子化合物の総体)プロジェクトに代表されるように,昨今,ディスカバリーを志向したノンターゲットメタボローム解析もしくはリピドーム解析の重要性が認識されるようになってきました.そこで今回,ガスクロマトグラフィー質量分析(GC-MS)や液体クロマトグラフィー質量分析(LC-MS)を用いたノンターゲット解析用のデータを,どのように解析し,どのように解釈すれば良いか?という疑問に答えるための,ソフトウェア講習会を実施致します.全くメタボローム解析を行ったことが無い方も理解できるように講習は行いますが,原則,「すでに分析データを取得し始めている・もしくは取ったことがある」方にフォーカスして,講習を進めたいと思っております.また時間の都合上,GC-MSとLC-QTOF/MSの計測データの前処理,代謝物テーブルの作成方法,未知化合物の構造推定,そして統計解析という,計4トピックに焦点を絞りますが,興味のある方はぜひご参加ください.

参加登録(100人で締め切ります):定員に達したため,応募を締め切りました.たくさんの応募,ありがとうございました!

日時:11月12日9時-18時

場所:理化学研究所横浜キャンパス(鶴見)交流棟ホール

アクセス:https://www.yokohama.riken.jp/access/

スケジュール

9:00-9:15 挨拶・趣旨の説明・簡単なメタボローム解析のイントロダクション 講師・有田正規(遺伝研・理研CSRS)

9:15-10:30 GC-MSデータの前処理から化合物同定・データのキュレーション方法 講師・津川裕司(理研CSRS・IMS)

(15分休憩)

10:45-12:00 LC-MS/MSを用いたノンターゲットリピドミクスとデータ解釈法 講師・津川裕司

(昼休み1時間・理研内の食堂にて自由に・Suicaでの支払いのみ可能です)

13:00-14:15 LC-MS/MSを用いた親水性代謝物のプロファイリングとデータ解釈法 講師・津川裕司

(15分休憩)

14:30-15:30 未知マススペクトルからの構造推定方法と演習 講師・津川裕司

15:30-16:00 多変量解析の背景理論の説明(講義形式) 講師・山本博之(HMT)

(15分休憩)

16:15-17:15 多変量解析演習(主成分分析・PLS-DA・PLS回帰) 講師・櫻井望(国立遺伝学研究所)

様子を見て,総合討論・質疑応答(最大18時まで)

主催:質量分析インフォマティクス研究会(日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)),国立遺伝学研究所DDBJセンター(共同開催)

協力:理化学研究所,ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ


【ご挨拶】

ESI友の会は,日本のメタボロミクス研究を盛り上げよう!もっと色々な人たちにメタボロミクスの技術を使えるようになってもらって,日本の科学を発展させよう!!という目的で,メタボロミクス研究者の中から有志が集まって結成されたコミュニティです.「ESI」という名前がついていますが,集まっている人たちは本当に様々です.扱っているサンプルでいえば微生物・食品・動植物,分離装置でいえばガスクロマトグラフィー・液体クロマトグラフィー・キャピラリー電気泳動・超臨界流体,検出装置でいえば,四重極型・飛行時間型・フーリエ変換型・タンデム型(QqQ・Q-TOF)・Orbitrap.さらにデータ処理や統計学を専門としている人がいます.「メタボロミクスをはじめるなら今!!」というくらい,メタボロミクス研究はいま多くの研究分野から注目を集めています.従来,メタボロミクスの技術は難しく一筋縄ではいかないから手を出しにくい…と言われてきました.しかしその時代はもう終わりつつあります!ESI友の会で集まった人たちは,それぞれ目的に応じたメタボロミクスプロトコールを開発し,実用的なシステムを構築してきました.そして今回,それぞれの技術を持ち寄り,「メタボロミクスのプロトコール集」を作成致しました.これを自由にダウンロードしていただき,日本の研究者の皆様方の一助になることをESI友の会は目指しています.もちろん,これからも様々な意見を取り入れ,改定を重ねていき,より良いメタボロミクスプロトコール集を作成・更新していきたいと思っています.乱筆ではありますが,これからの日本科学の発展を願いメタボロミクス研究の立場から日本科学に貢献できるよう日々精進して参ります.

ESI友の会 一同

ESI友の会 プロトコール集執筆者一覧

大阪大学 松田史生(Matsuda Fumio):幹事

九州大学 馬場健史(Bamba Takeshi):幹事

山形大学 及川彰(Oikawa Akira):幹事

理化学研究所 池田和貴(Ikeda Kazutaka)

理化学研究所 澤田有司(Sawada Yuji)

理化学研究所 佐々木亮介(Sasaki Ryosuke)

理化学研究所 津川裕司(Tsugawa Hiroshi)

神奈川工科大学 飯島陽子(Iijima Yoko)

中央農業総合研究センター 岡崎圭毅(Okazaki Keiki)

埼玉大学 宮城敦子(Miyagi Atsuko)

九州大学 和泉自泰(Izumi Yoshihiro)

神戸大学 西海信(Nishiumi Shin)

HMT 山本博之(Yamamoto Hiroyuki)

ジーエルサイエンス株式会社 宮川浩美(Miyagawa Hiromi)