GC/MSメタボロミクスでは，基本的にはメトキシアミンによるオキシム化，およびMSTFAによるトリメチルシリル化（TMS化）を行います．
ですので，「ありのまま」を測定するのではなく，「誘導体化後」の化合物を測定するわけですので，時としてデータの解釈に注意が必要となります．
たとえば，メトキシアミンはケトンのC=Oに対して反応をするわけですが，この誘導体化後の形，C=N-O-CH3に関しては，E体として，およびZ体として，両方の反応物が同時にできてしまいます．そして，この２つは保持時間が異なるため，ケトン基を持つ化合物に関してはピークが２つ存在するものがあります．
では，この２つのピークのうち，どちらがE体で，どちらがZ体なのでしょうか？
また，どちらのほうがピークが大きくなるのでしょうか？（反応生成物としてできやすいのか？）
また，たとえばアミノ基-NH2を持っている化合物に関して，この反応性プロトンに対してTMS基が付くことになりますが，-NH2の反応効率は化合物の立体配座や誘導体化条件に深く関わり，
-NH2・・・何も反応しない
-NH(TMS)・・・１つだけ反応する
-N(TMS)2・・・両方のHがTMSに置き換わる
というように，時には１つの化合物から上記３つのパターンのピークが，すべて検出されることになります．
それでは，ある化合物に着目した時，TMSは何個入るのか？また，どれが一番ピーク強度が高く出るのか？保持時間はどのように変わるのか？
この上，これら反応物の生成比は，時間，温度によっても変化することが知られており，時にアミノ酸の定量には注意が必要となります．
以上のような，保持時間，マススペクトルの化合物ライブラリーに加えて，
「化合物の誘導体化後の立体構造」
ならびに
「E体Z体の区別」
「どの誘導体化産物がメジャーに観測されるか」
「TMSの数や時間変化等」
の情報を，
大阪大学工学研究科D1の松尾晃子さん
ジーエルサイエンスの宮川浩美さん
がまとめてくれました．どうもありがとうございます！
少し，専門家向けではありますが，誘導体化後のSMILES（立体構造を定義するためのフォーマットの１つ）や，「分子イオン（親イオン，プリカーサーイオン）」の情報も含まれています．
分子イオンは，EI法でフラグメンテーションを起こさせてしまうと，強度的にはすごく低くなってしまい，見えないことも多いです．ですが，「意外と」見えます．
誘導体化後の形を整理していただいたことで，「どのm/zが分子イオンか？」や，実際の所，メチル基が１つ抜けた[M-15]+として検出されることが多いですが，そのような情報も含めて，整理していただいています．これらは，同位体標識実験におけるトレーサーイオンとしても使うことができるので，便利かと思います．
それでは，よろしくお願い致します．
TMSをまとめたエクセルファイルはこちらから：https://goo.gl/7njJy9