ביצירותיה עסקה מאיה אטון בדיאלוג שבין תהליכי חשיבה, מוטיבים ,חומרים ודימויים. היצירות שלה קושרות דימויים חזותיים, חומרים ומרקמים, ויוצרות חיבורים מסקרנים ומורכבים. בתהליך יצירתה, היא מפרקת, מכפילה וממקמת מחדש אורגניזם חדש, ובכך מאפשרת לצופה לגעת בגבולות ההוויה האנושית דרך מגע החומר על גבי חומר. הקו והרישום תופסים מקום מרכזי ביצירתה ומהווים את נקודת ההתחלה עד לסך השלם.

מאיה אטון בונה נוף קוסמי שמתנהל בקנה מידה משלו. היא עובדת עם פיסול, רישום ואנימציה כדי ליצור נוף קטסטרופלי שלא ניתן לקשור לזמן ולמקום ספציפיים. עבודתה מקיפה מגוון מדיות הכוללות ציורי קיר, רישומים, הדפסים, חפצים פיסוליים, רדי-מיידס וסאונד. באמצעות אלה היא משקפת את ההיסטוריה של התרבות הפופולרית והצומח מתוך המיתוס, הנרטיב והמדע.

התערוכות והיצירות שלה יצרו רומן מתמשך עם הצופה, שנרקם בשכבות לאורך השנים. התהליך האמנותי שלה מורכב ודינמי, וכל אלמנט תורם להתפתחות ולהעמקה. התהליך מצטבר כמו שכבות של בדים המתווספים זה על גבי זה, כך גם היצירות והשנים מוסיפות שכבות של משמעות, עומק, שאלות ותהיות והגשמות יצירתיות לאורך הזמן. המפגש עם יצירותיה מגלה בהדרגה את השכבות העמוקות של רבדיה ושל נשמתה.