MethodsForGenomeAnalyses

ATAC-seq

Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing.

Buenrostro et al., (2013) Nat. Methods 10:1213-1218

Buenrostro JD. et al., (2015) Current Protocols in Molecular Biology 21.29.1-21.29.9

Hyperactive Tn5 transposaseを利用する。

Open Chromatin Regionsを同定できる。

ChIP-seqやMNase-seqやDNase-seqとの代替手段として使える。