MethodsForGenomeAnalyses
ATAC-seq
Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing.
Buenrostro et al., (2013) Nat. Methods 10:1213-1218
Buenrostro JD. et al., (2015) Current Protocols in Molecular Biology 21.29.1-21.29.9
Hyperactive Tn5 transposaseを利用する。
Open Chromatin Regionsを同定できる。
ChIP-seqやMNase-seqやDNase-seqとの代替手段として使える。