動物門の最大公約的な分類系、全32門をもとに、分岐年代を考えるのに重要な化石（最古の化石など）の記録をリストにしておこうと思います。。(2015年10月。まだ何も書いてません。)
No. 門名称(よみ / 英語 ) 門における最初の全ゲノム解読論文
非左右相称動物群 6門
1. 海綿動物門(かいめん / Porifera) Srivastava et al. 2010, Nature
2. 板形動物門(ばんけい / Placozoa) Srivastava et al. 2008, Nature
3. 菱形動物門(りょうけい / Rhombozoa)
4. 直泳動物門(ちょくえい / Orthonectida)
5. 刺胞動物門(しほう / Cnidaria) Putnam et al. 2007, Science
6. 有櫛動物門(ゆうせつ /Ctenophora) Moroz et al. 2014, Nature
左右相称乃内冠輪動物群14門
7. 扁形動物門(へんけい Platyhelminthes) Berriman 2009, Nature
8. 紐形動物門(ひもがた / Nemertea)
9. 顎口動物門(がっこう / Gnathostomulida)
10. 腹毛動物門(ふくもう/ Gastrotrichia)
11. 輪形動物門(りんけい / Rotifera)
12. 鈎頭動物門(こうとう / Acanthocephala)
13. 内肛動物門(ないこう / Entoprocta)
14. 外肛動物門(がいこう / Bryozoa, Ectoprocta)
15. 箒虫動物門(ほうきむし / Phoronida)
16. 腕足動物門(わんそく / Brachiopoda) Luo et al. 2015, Nature Commun.
17. 毛顎動物門(もうがく / Caetognatha)
18. 有輪動物門(ゆうりん / Cycliophora)
19. 環形動物門(かんけい / Annelida) Simakov 2012 Nature
[含, 有鬚動物門(ゆうしゅ / Pogonophora),
星口動物門(ほしくち / Sipuncula),
螠虫動物門(ゆむし / Echiura) ]
20. 軟体動物門(なんたい / Mollusca) ( Simakov 2012 Nature )
左右相称乃内脱皮動物群8門
21. 線形動物門(せんけい / Nematoda) CSC 1998, Science
22. 類線形動物門(るいせんけい / Nematomorpha)
23. 鰓曳動物門(えらひき / Puriapulida)
24. 胴甲動物門(どうこう / Loricifera)
25. 動吻動物門(どうふん / Kinorhyncha)
26. 緩歩動物門(かんぽ / Tardigrada)
27. 有爪動物門(ゆうそう / Onychophora)
28. 節足動物門(せっそく / Arthropoda) Adams et al. 2000, Science.
左右相称乃内新口動物群4門
29. 珍渦虫動物門(ちんうずむし / Xenoturbellida)
30. 棘皮動物門(きょくひ / Echinodermata) SUGSC et al. 2006, Science.
31. 半索動物門(はんさく / Hemichordata)
32. 脊索動物門(せきさく/ Chordata) IHGSC 2001, Nature & Venter et al 2001, Science