Anna Victoria Mauad

Doutorado | 2° ano

annavmauad@gmail.com


Orientador

Eric de Camargo Smidt


Coorientadora

Viviane da Silva-Pereira

Filogenômica da subtribo Pleurothallidinae (Orchidaceae) com aplicação em estudos filogeográficos em Barbosella miersii, espécie endêmica da Mata Atlântica

Pleurothallidinae é a maior subtribo de orquídeas, com mais de 5.000 espécies exclusivamente neotropicais. Estudos moleculares revelam que a subtribo tem origem recente e que passou por eventos de intensa especiação nos Andes e florestas tropicais durante os períodos Mioceno e Pleistoceno, sendo um grupo interessante para pesquisas evolutivas. No entanto, não há estudos genômicos focados em Pleurothallidinae, e, portanto, não há conhecimento e utilização de marcadores moleculares capazes de discriminar gêneros e espécies com bom suporte nas filogenias. Tal situação apenas aprofunda os debates taxonômicos na subtribo, o que dificulta o avanço em questões evolutivas e voltadas à conservação. Diante do exposto, foi realizado o primeiro estudo filogenômico em Pleurothallidinae, com o objetivo de descrever comparativamente as características estruturais e moleculares do genoma de cloroplasto, bem como encontrar regiões variáveis para serem exploradas em estudos filogenéticos. Foram sequenciados os genomas plastidiais completos de nove espécies de Pleurothallidinae, representando seis das nove afinidades sensu Karremans. Todos os nove plastomas apresentam a típica estrutura quadripartida e conteúdo gênico similar, com variação apenas na composição dos genes ndh. A perda independente de diferentes conjuntos desses genes teve impacto no conteúdo das bordas das regiões invertidas repetidas e no tamanho da região de cópia única pequena, e consequentemente no comprimento total dos plastomas. As análises das 68 sequências codificadoras indicaram o mesmo padrão de uso de códon para todos os genomas, bem como detectaram seleção positiva em 15 genes. Foram identificadas 67 sequências polimórficas microssatélites e foram escolhidas dez regiões dentre as mais variáveis dos plastomas como potenciais marcadores moleculares. Foram desenhados primers para essas sequências com o intuito de auxiliar estudos filogenéticos em Pleurothallidinae e de impulsionar estudos populacionais na subtribo. Essas regiões serão testadas para a realização de estudo filogeográfico em Barbosella miersii, Pleurothallidinae endêmica da Mata Atlântica brasileira.
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