5 План создания курса

В заявке совсем куцый вариант оказался, но есть ссылка на этот сайт, поэтому дополню основными идеями подготовки лекций по сути

Структура курса: 

Часть 1 «Биологические проблемы метрологии»

1.1 Принципы биологии: Г. Спенсер (1864), Д. Нобл (2006) и Дж. Плоппер (2013), П.И. Белобров (2014)

1.2 От генезиса почв В.В. Докучаева к метагенетике живой почвы (М.В. Семенов)

1.3 Биологические значения: молекул, супрамолекул, внутриклеточных органов, меры митотических стволовых клеток (https://imsc.allencell.org/)

1.4 Онтогенез (от клетки к человеку), развертки В.Г. Черданцева

1.5 Проекты микробиома и генома Земли

1.6 Биологические значения в иммунитете симбиоза

1.7 Логика случая в биологических событиях (Е.В. Кунин)

1.8 Каскад идей Дж. Шапиро: природные генетические технологии, перезаписываемый геном, геном не является островком

1.9 Эпигенетика, меры наследования хологенома, негенетическое наследование

1.10 Органы чувств растений, симбиогенез

1.11 Биологические меры Нобла (музыка, танец, экзосомы)

1.12 Биологические значения физиологических мер

Часть 2 «Математическая теория биологических мер»

2.1. Множества и классы, их смысл в математике, физике, биологии и химии

2.2. Меры, внутренние и внешние меры

2.3. Продолжения мер в абстрактных и «реальных» пространствах

2.4. Измеримые функции математики и биологии

2.5. Математическое и биологическое интегрирование

2.6. Общие функции биологических множеств

2.7. Произведения биологических пространств

2.8. Биологические отображения и функции 

2.9. Вероятность и условные биологические меры

2.10. Локально компактные пространства

2.11. Меры Хаара и Хаусдорфа

2.12. Мера и топология в «биологических» группах

Часть 3 «Квантовая система единиц в биологии»

3.1. Переопределение системы единиц СИ 20.5.2019 «на все времена для всех народов». 

3.2. Нахождение биологических чисел (BioNumbers), физические константы в биологических процессах и структурах

3.3. Квантовый эффект Холла, современная точка зрения на точные измерения констант 

3.4. Квантование энергии и квант действия, постоянная Планка, действие в биологии

3.5. Квант сопротивления и квант проводимости, постоянная фон Клитцинга, примеры согласования волновых функций

3.6. Переносчики взаимодействия (медиаторы), элементарные частицы (физика, химия, биология), устойчивые, равновесные и беспокойные состояния

3.7. Квант магнитного потока, постоянная Джозефсона, связь между электрическим током и фазой волновой функции

3.8. Закон Авогадро, связь моля, кг, дальтона и числа Авогадро, примеры необходимых и достаточных условий из биологии

3.9. Закон Кулона, элементарный заряд, заряд, спин и масса электрона

3.10. Закон всемирного тяготения Ньютона, космологическая постоянная и квантовая гравитация 

3.11. Квантование электромагнитных волн, фотон – квант света, квантование звуковых волн, фонон – квант звука

3.12. Константа Больцмана, понятие энтропии в физике и биологии, распределение и мера Гиббса

Часть 4 «Химические и биологические коды клетки» 

4.1. Преобразование семантических идей Марчелло Барбьери в биологические измерения клетками самих себя и соседних клеток

4.2. 63 определения жизни из [1, с.255-264] разных ученых (1802-2002), добавим наши определения, и студентов (если они новые)

4.3. В природе много органических кодов, и соответствующих им «органических воспоминаний». Как эмбрионы создают свою собственную сложность с их помощью? [1, с.67-88]

4.4. Принципы семантической биологии клетки [1, с.219-254]. Понятие информации пересмотреть с позиций 4.1.

4.5. Изучение всех кодов жизни с помощью стандартных методов науки. Генетический код и коды культуры известны давно. Новое в этой области: изучение всех кодов, которые появились после генетического кода и до кодов культуры. Существование этих органических кодов - крупный экспериментальный факт, которые имеют необычайные теоретические последствия [2, с.187].

4.6. Большинство событий макроэволюции были связаны с возникновением новых органических кодов, и это дает новую реконструкцию истории жизни [2, с.75].

4.7. Смысл заключается в том, что коды содержат значение, и поэтому надо ввести в биологию понятие биологического значения [2, с.17]. 

4.8. Третье теоретическое значение вытекает из того факта, что органические коды были в высшей степени сохранены в эволюции, что означает, что они являются величайшими инвариантами жизни [2, с.135].

4.9. Трактовка органической информации и органического значения в терминах номинируемых сущностей – откровение (из предисловия Jannie Hofmeyr). Номинируемые объекты (nominable entities) – это новый класс физических наблюдаемых, объективных, но не поддающихся измерению [2, с.19-33]. Объяснить, как они измеримы биологическими мерами.

4.10. «Семантическая теория эволюции»: жизнь формируется не одним законом естественного отбора, а множеством законов, которые напоминают грамматические правила языка [3, с.].

4.11. Замечания, «разборка полетов», очень сложные моменты

4.12. Яркие находки, требующие своих разделов, связи между модулями

Литература к Части 4

[1] = [Barbieri2003] Barbieri M. The organic codes. An introduction to semantic biology. Cambridge, UK: Cambridge University Press. 2003. 317 p.

[2] = [Barbieri2015] Marcello Barbieri. Code Biology: A New Science of Life. Springer, 2015. 236 p.

[3] = [Barbieri2019] Marcello Barbieri. The Semantic Theory of Evolution. Routledge, 2019. 196 p.