Escudo del municipio
Aprobado: Decreto 6/1999, de 12 de enero, por el que se autoriza al Ayuntamiento de Villanueva del Arzobispo (Jaén), para modificar su escudo heráldico y la adopción de su bandera municipal. (BOJA 16/2/1999)
Descripción: Escudo partido. Primero: En campo de azur, la imagen de la Virgen de la Fuensanta, con todos sus atributos, sosteniendo al niño en sus brazos, todo al natural. Segundo: En campo de plata, un león rampante, de gules. Contorno español y timbre de corona real española cerrada.
Significado: La Virgen de la Fuensanta es la patrona de la población. El león era pieza heráldica del escudo del arzobispo de Toledo Pedro Tenorio, quien otorgó el escudo en su integridad a la villa tras la independencia de Iznatoraf, de quien dependía. En La Iruela también aparece el león en el escudo por el arzobispo Tenorio, pero en esta ocasión es de oro. En realidad, el león del escudo de Pedro Tenorio estaba cargado con fajas jaqueladas de plata y azur.
Bandera del municipio
Aprobada: Decreto 6/1999, de 12 de enero, por el que se autoriza al Ayuntamiento de Villanueva del Arzobispo (Jaén), para modificar su escudo heráldico y la adopción de su bandera municipal. (BOJA 16/2/1999)
Descripción: Bandera rectangular, vez y media más larga que ancha, que en campo blanco, orillado todo su borde por una filiera morada, cargará íntegramente con su timbre, el escudo oficial de Villanueva del Arzobispo, ajustando el eje geométrico de éste al centro del vexilo, con una altura igual a los dos tercios del ancho de la bandera.
Significado: El fondo blanco representa a la pureza de la Virgen de la Fuensanta, patrona del municipio, y además es el color del campo del escudo del escudo del arzobispo Pedro Tenorio, como reconocimiento expreso al deseo de éste de que Villanueva contase con un vexilo propio. El borde morado simboliza la dependencia durante siglos de esta localidad del arzobispado de Toledo.