Nilearnを使ったfMRIデータ処理ーscikit-learnとの連携による機械学習までー

投稿日: 2017/05/21 14:29:35

機械学習勉強会でのLT発表資料＆Pythonコード（下記添付）をアップロードしました。

PythonのパッケージであるNilearn(http://nilearn.github.io/)を使ってfMRIデータを読み込み，

scikit-learnに渡して機械学習させ，その結果を再びNilearnで画像化する方法です。

一連の処理をすべてPythonで簡単に行うことができるのでかなり便利です。

Nilearnの使用感としてはMATLABでやるより速い・簡単・グラフィックスが良い等がひとまずの実感です。

Pythonの豊富なパッケージとスムーズに連携できるのも◎

※資料中はコードを一部省略しているので完全版は添付のものをご参照ください。

※使用しているfMRIデータは共有できないのでお手持ちまたはダウンロード可能なデータをご利用してください（ディレクトリ書換えが必要）。

キーワード：

Python，Nilearn，scikit-learn，fMRI，画像解析，機械学習（machine learning），サポートベクターマシン（SVM），階層的凝集クラスタリング

全く関係ないですがこんなの作ってみました