A classificação proposta por Oehl et al. (2011) é baseada em trabalhos prévios do mesmo grupo de pesquisa com vários grupos dentro do Filo Glomeromycota. Estas análises foram baseadas tanto em caracteres morfológicos como genéticos. Esta classificação é caracterizada pela proposta de vários táxon em diferentes níveis da hierarquia taxonômica, desde classe até gêneros. A classificação apresentada abaixo inclui também táxons adicionais propostos por Goto et al. (2012).
Filo: Glomeromycota
Classe: Glomeromycetes
Ordem: Glomerales
Família: Glomeraceae
Gêneros: Glomus, Funneliformis, Simiglomus, Septoglomus
Família: Entrophosporaceae
Gêneros: Claroideoglomus, Viscospora, Entrophospora, Albahypha
Ordem: Diversisporales
Família: Acaulosporaceae
Gêneros: Acaulospora, Kuklospora
Família: Sacculosporaceae
Gêneros: Sacculospora
Família: Pacisporaceae
Gêneros: Pacispora
Família: Diversisporaceae
Gêneros: Diversispora, Otospora, Redeckera, Tricispora
Ordem: Gigasporales
Família: Gigasporaceae
Gêneros: Gigaspora
Família: Scutellosporaceae
Gêneros: Scutellospora, Orbispora
Família: Racocetraceae
Gêneros: Racocetra, Cetraspora
Família: Dentiscutataceae
Gêneros: Dentiscutata, Fuscutata, Quatunica
Família: Intraornatosporaceae
Gêneros: Intraornatospora, Paradentiscutata
Classe: Paraglomeromycetes
Ordem: Paraglomerales
Família: Paraglomeraceae
Gêneros: Paraglomus
Classe: Archaeosporomycetes
Ordem: Archaeosporales
Família: Archaeosporaceae
Gêneros: Archaeospora, Intraspora
Família: Ambisporaceae
Gêneros: Ambispora
Família: Geosiphonaceae
Gêneros: Geosiphon
Oehl F, Sieverding E, Palenzuela J, Ineichen K, da Silva GA (2011) Advances in Glomeromycota taxonomy and classification. IMA Fungus 2:191–199
Goto BT, da Silva GA, de Assis DM, Silva DKA, Souza RG, Ferreira ACA, Jobim K, Melo CMA, Viera HEE, Maia LC, Oehl F (2012) Intraornatospora (Gigasporales), a new family with two new genera and two new species. Mycotaxon 119:117–132