一、微生物油脂
微生物生產的油脂又稱為單細胞油 (single cell oils, SCOs)，相較於動植物油脂，單細胞油具有下列優點：(1)微生物生長週期短，不受季節氣候的影響；(2)無資源枯竭、與糧食競爭或素食者不便的疑慮；(3)利用培養機組成或生長條件之調控，可誘導菌種產生特定組成的油脂並提高產量。因此運用微生物生產生質柴油或機能性油脂的技術日益受到重視。
二、產油真菌的應用
產油微生物 (oleaginous microorganisms)定義為菌體含油量佔生物量比例達20% 以上之微生物，菌體油脂含量甚至可達70% 以上，於微藻、細菌與真菌皆有產油菌株被報導。產油真菌 (oleaginous fungi)之中，產油酵母是最早受到矚目的類群，近年來產油絲狀真菌由於具備下列優勢：(1)油脂轉化後，其組成接近現有生質柴油之規格；(2)以菌絲體之型態生長，易於回收；(3)可利用多樣之有機廢棄物為培養基質，助於環保減廢並降低生產成本；(4)適合發展固態發酵製程，減少設備的支出與水資源的使用；因此，近年來逐漸受到重視。
產油真菌的應用可分為兩個面向，分別為機能性油脂與生質柴油。機能性油脂方面，產油真菌可產生w-6生合成途徑之γ-次亞麻油酸 (Gamma-linolenic acid, GLA)與花生四烯酸 (Arachidonic acid, ARA)，目前國內於衛生福利部食品藥物管理署公告可供食品使用原料清單之中，以微生物及其來源製取之γ-次亞麻油酸及花生四烯酸，分別由卷枝毛黴 (Mucor circinelloides) 及高山被孢黴 (Mortierella alpina) 兩種真菌生產，目前已經有商品問市。
對於能源產業而言，以產油真菌做為生產生質柴油之料源仍在起步階段，研發多著重於下列幾個面向：(1)優良菌株篩選，除了含油量高，具備適當的脂肪酸組成易於轉化為生質柴油、生長快速以及多樣化培養基質的利用能力為重要特性；(2)製程開發著重於有機廢棄物的利用及節能減碳降低生產成本的策略；(3)以傳統突變或基因操作改良菌種，提昇菌種性能。在產業化方面，近年已有重大進展，Purthanol Resources Ltd 於2014年3月宣佈已建立產油真菌生產技術，將於十二個月內建立營運工廠，預估油脂產能可達一千萬公升，因此除了植物油之外，該公司將具有新穎且獨特的油脂來源，此生產系統運用生質柴油或生質酒精之副產物為碳源培養產油真菌，兼具減廢與減碳之重大效益。台灣真菌資源相當豐富，探索具有產業潛力的產油真菌資源，為本土新興能源產業研發的基礎。
三、食品所生物資源保存及研究中心建置產油真菌資源庫
產油真菌近年才受到重視，歐美等技術領先國已開始關注並著手產業化研發，為提供國內各界之研發素材以掌握先機，食品所生資中心著手建置國內自主之產油真菌資源，目前已建立產油真菌篩選平台，運用螢光染色快速識別產油潛力菌株，再由產油與生長特性之測定結合分子鑑定分析進行菌種加值，並透過生資中心之菌種服務平台對外提供菌種、資訊及相關服務，未來將逐步擴充產油真菌資源之多樣性與規模，支援各界的研發與應用。